Protein–RNA interactions for Protein: Q00169

PITPNA, Phosphatidylinositol transfer protein alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNAQ00169 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PITPNAQ00169 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PITPNAQ00169 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PITPNAQ00169 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PITPNAQ00169 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PITPNAQ00169 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PITPNAQ00169 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PITPNAQ00169 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PITPNAQ00169 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PITPNAQ00169 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PITPNAQ00169 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PITPNAQ00169 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PITPNAQ00169 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PITPNAQ00169 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PITPNAQ00169 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PITPNAQ00169 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PITPNAQ00169 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PITPNAQ00169 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PITPNAQ00169 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PITPNAQ00169 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PITPNAQ00169 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PITPNAQ00169 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PITPNAQ00169 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PITPNAQ00169 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PITPNAQ00169 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PITPNAQ00169 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PITPNAQ00169 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PITPNAQ00169 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PITPNAQ00169 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PITPNAQ00169 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PITPNAQ00169 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PITPNAQ00169 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PITPNAQ00169 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PITPNAQ00169 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PITPNAQ00169 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PITPNAQ00169 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PITPNAQ00169 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PITPNAQ00169 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PITPNAQ00169 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PITPNAQ00169 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PITPNAQ00169 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PITPNAQ00169 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITPNAQ00169 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms