Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM3AP98173 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM3AP98173 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM3AP98173 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM3AP98173 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM3AP98173 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM3AP98173 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM3AP98173 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM3AP98173 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM3AP98173 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM3AP98173 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM3AP98173 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM3AP98173 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM3AP98173 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM3AP98173 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM3AP98173 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM3AP98173 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM3AP98173 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM3AP98173 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM3AP98173 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM3AP98173 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM3AP98173 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM3AP98173 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM3AP98173 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM3AP98173 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM3AP98173 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM3AP98173 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM3AP98173 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM3AP98173 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM3AP98173 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM3AP98173 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM3AP98173 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM3AP98173 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM3AP98173 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM3AP98173 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM3AP98173 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM3AP98173 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM3AP98173 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM3AP98173 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM3AP98173 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM3AP98173 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM3AP98173 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM3AP98173 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM3AP98173 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM3AP98173 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM3AP98173 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM3AP98173 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM3AP98173 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM3AP98173 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM3AP98173 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM3AP98173 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM3AP98173 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM3AP98173 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM3AP98173 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM3AP98173 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM3AP98173 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM3AP98173 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM3AP98173 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM3AP98173 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM3AP98173 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM3AP98173 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM3AP98173 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM3AP98173 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM3AP98173 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM3AP98173 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM3AP98173 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM3AP98173 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM3AP98173 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM3AP98173 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM3AP98173 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM3AP98173 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM3AP98173 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM3AP98173 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM3AP98173 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM3AP98173 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM3AP98173 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM3AP98173 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM3AP98173 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM3AP98173 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM3AP98173 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM3AP98173 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM3AP98173 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM3AP98173 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM3AP98173 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM3AP98173 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM3AP98173 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM3AP98173 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM3AP98173 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM3AP98173 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM3AP98173 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM3AP98173 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM3AP98173 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM3AP98173 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM3AP98173 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM3AP98173 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM3AP98173 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM3AP98173 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM3AP98173 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM3AP98173 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM3AP98173 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms