Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

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Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CBX1P83916 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CBX1P83916 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CBX1P83916 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CBX1P83916 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CBX1P83916 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CBX1P83916 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CBX1P83916 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CBX1P83916 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CBX1P83916 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CBX1P83916 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CBX1P83916 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CBX1P83916 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CBX1P83916 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CBX1P83916 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CBX1P83916 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CBX1P83916 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CBX1P83916 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CBX1P83916 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CBX1P83916 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CBX1P83916 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CBX1P83916 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CBX1P83916 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CBX1P83916 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CBX1P83916 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CBX1P83916 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CBX1P83916 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CBX1P83916 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CBX1P83916 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CBX1P83916 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CBX1P83916 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CBX1P83916 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CBX1P83916 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CBX1P83916 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CBX1P83916 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CBX1P83916 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CBX1P83916 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CBX1P83916 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CBX1P83916 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CBX1P83916 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CBX1P83916 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CBX1P83916 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CBX1P83916 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CBX1P83916 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CBX1P83916 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CBX1P83916 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CBX1P83916 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CBX1P83916 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CBX1P83916 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CBX1P83916 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CBX1P83916 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CBX1P83916 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CBX1P83916 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CBX1P83916 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CBX1P83916 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CBX1P83916 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CBX1P83916 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CBX1P83916 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CBX1P83916 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CBX1P83916 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CBX1P83916 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CBX1P83916 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CBX1P83916 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CBX1P83916 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CBX1P83916 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CBX1P83916 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CBX1P83916 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CBX1P83916 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CBX1P83916 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CBX1P83916 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CBX1P83916 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CBX1P83916 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CBX1P83916 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CBX1P83916 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CBX1P83916 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CBX1P83916 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CBX1P83916 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CBX1P83916 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CBX1P83916 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CBX1P83916 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CBX1P83916 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CBX1P83916 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CBX1P83916 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CBX1P83916 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CBX1P83916 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CBX1P83916 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CBX1P83916 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CBX1P83916 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CBX1P83916 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CBX1P83916 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CBX1P83916 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CBX1P83916 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CBX1P83916 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CBX1P83916 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CBX1P83916 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CBX1P83916 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CBX1P83916 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CBX1P83916 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CBX1P83916 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CBX1P83916 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
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