Protein–RNA interactions for Protein: P78396

CCNA1, Cyclin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA1P78396 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCNA1P78396 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCNA1P78396 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCNA1P78396 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCNA1P78396 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CCNA1P78396 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCNA1P78396 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CCNA1P78396 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCNA1P78396 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCNA1P78396 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCNA1P78396 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCNA1P78396 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCNA1P78396 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCNA1P78396 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCNA1P78396 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCNA1P78396 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCNA1P78396 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCNA1P78396 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCNA1P78396 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCNA1P78396 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCNA1P78396 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CCNA1P78396 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCNA1P78396 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCNA1P78396 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCNA1P78396 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCNA1P78396 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CCNA1P78396 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCNA1P78396 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCNA1P78396 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCNA1P78396 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCNA1P78396 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CCNA1P78396 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCNA1P78396 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCNA1P78396 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCNA1P78396 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCNA1P78396 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCNA1P78396 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCNA1P78396 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCNA1P78396 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCNA1P78396 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCNA1P78396 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCNA1P78396 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCNA1P78396 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCNA1P78396 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCNA1P78396 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCNA1P78396 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCNA1P78396 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCNA1P78396 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCNA1P78396 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCNA1P78396 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCNA1P78396 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCNA1P78396 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCNA1P78396 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCNA1P78396 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCNA1P78396 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCNA1P78396 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCNA1P78396 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCNA1P78396 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCNA1P78396 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCNA1P78396 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCNA1P78396 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCNA1P78396 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCNA1P78396 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCNA1P78396 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCNA1P78396 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCNA1P78396 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCNA1P78396 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCNA1P78396 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCNA1P78396 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCNA1P78396 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCNA1P78396 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCNA1P78396 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CCNA1P78396 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CCNA1P78396 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCNA1P78396 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCNA1P78396 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCNA1P78396 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCNA1P78396 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCNA1P78396 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCNA1P78396 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCNA1P78396 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCNA1P78396 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCNA1P78396 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCNA1P78396 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCNA1P78396 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCNA1P78396 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCNA1P78396 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCNA1P78396 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCNA1P78396 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCNA1P78396 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCNA1P78396 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCNA1P78396 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCNA1P78396 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCNA1P78396 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCNA1P78396 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCNA1P78396 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCNA1P78396 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCNA1P78396 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CCNA1P78396 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCNA1P78396 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms