Protein–RNA interactions for Protein: P78369

CLDN10, Claudin-10, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN10P78369 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLDN10P78369 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLDN10P78369 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLDN10P78369 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLDN10P78369 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CLDN10P78369 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLDN10P78369 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLDN10P78369 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLDN10P78369 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDN10P78369 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDN10P78369 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDN10P78369 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDN10P78369 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDN10P78369 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDN10P78369 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDN10P78369 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDN10P78369 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDN10P78369 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDN10P78369 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDN10P78369 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDN10P78369 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDN10P78369 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDN10P78369 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDN10P78369 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLDN10P78369 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CLDN10P78369 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLDN10P78369 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLDN10P78369 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLDN10P78369 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLDN10P78369 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLDN10P78369 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLDN10P78369 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLDN10P78369 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CLDN10P78369 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLDN10P78369 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLDN10P78369 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLDN10P78369 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLDN10P78369 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLDN10P78369 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLDN10P78369 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CLDN10P78369 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLDN10P78369 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CLDN10P78369 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLDN10P78369 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CLDN10P78369 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CLDN10P78369 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLDN10P78369 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLDN10P78369 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CLDN10P78369 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDN10P78369 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDN10P78369 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDN10P78369 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDN10P78369 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDN10P78369 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDN10P78369 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDN10P78369 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDN10P78369 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDN10P78369 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDN10P78369 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDN10P78369 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDN10P78369 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDN10P78369 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDN10P78369 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDN10P78369 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLDN10P78369 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLDN10P78369 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLDN10P78369 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLDN10P78369 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLDN10P78369 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLDN10P78369 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLDN10P78369 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLDN10P78369 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLDN10P78369 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLDN10P78369 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLDN10P78369 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLDN10P78369 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLDN10P78369 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLDN10P78369 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLDN10P78369 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CLDN10P78369 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLDN10P78369 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLDN10P78369 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLDN10P78369 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLDN10P78369 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLDN10P78369 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CLDN10P78369 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLDN10P78369 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLDN10P78369 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CLDN10P78369 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLDN10P78369 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLDN10P78369 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLDN10P78369 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLDN10P78369 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLDN10P78369 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLDN10P78369 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLDN10P78369 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLDN10P78369 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLDN10P78369 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLDN10P78369 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLDN10P78369 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms