Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PITX1P78337 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PITX1P78337 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PITX1P78337 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PITX1P78337 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PITX1P78337 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PITX1P78337 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PITX1P78337 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PITX1P78337 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PITX1P78337 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PITX1P78337 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PITX1P78337 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PITX1P78337 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PITX1P78337 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PITX1P78337 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PITX1P78337 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PITX1P78337 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PITX1P78337 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PITX1P78337 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PITX1P78337 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PITX1P78337 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PITX1P78337 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PITX1P78337 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PITX1P78337 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PITX1P78337 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PITX1P78337 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PITX1P78337 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PITX1P78337 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PITX1P78337 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PITX1P78337 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PITX1P78337 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PITX1P78337 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PITX1P78337 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PITX1P78337 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PITX1P78337 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PITX1P78337 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PITX1P78337 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PITX1P78337 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PITX1P78337 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PITX1P78337 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PITX1P78337 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PITX1P78337 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PITX1P78337 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PITX1P78337 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PITX1P78337 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PITX1P78337 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PITX1P78337 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PITX1P78337 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PITX1P78337 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PITX1P78337 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PITX1P78337 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PITX1P78337 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PITX1P78337 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PITX1P78337 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PITX1P78337 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PITX1P78337 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PITX1P78337 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PITX1P78337 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PITX1P78337 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PITX1P78337 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PITX1P78337 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PITX1P78337 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PITX1P78337 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PITX1P78337 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PITX1P78337 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PITX1P78337 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PITX1P78337 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PITX1P78337 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PITX1P78337 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PITX1P78337 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PITX1P78337 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PITX1P78337 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PITX1P78337 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PITX1P78337 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PITX1P78337 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PITX1P78337 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PITX1P78337 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PITX1P78337 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PITX1P78337 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PITX1P78337 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PITX1P78337 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PITX1P78337 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PITX1P78337 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PITX1P78337 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PITX1P78337 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PITX1P78337 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PITX1P78337 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PITX1P78337 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PITX1P78337 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PITX1P78337 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PITX1P78337 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PITX1P78337 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PITX1P78337 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PITX1P78337 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PITX1P78337 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PITX1P78337 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PITX1P78337 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PITX1P78337 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PITX1P78337 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PITX1P78337 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms