Protein–RNA interactions for Protein: P67936

TPM4, Tropomyosin alpha-4 chain, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM4P67936 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TPM4P67936 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TPM4P67936 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TPM4P67936 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TPM4P67936 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TPM4P67936 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TPM4P67936 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TPM4P67936 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TPM4P67936 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TPM4P67936 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TPM4P67936 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TPM4P67936 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TPM4P67936 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TPM4P67936 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TPM4P67936 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TPM4P67936 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TPM4P67936 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TPM4P67936 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TPM4P67936 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TPM4P67936 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TPM4P67936 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TPM4P67936 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TPM4P67936 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TPM4P67936 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TPM4P67936 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TPM4P67936 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TPM4P67936 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TPM4P67936 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TPM4P67936 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TPM4P67936 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TPM4P67936 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TPM4P67936 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TPM4P67936 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TPM4P67936 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TPM4P67936 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TPM4P67936 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TPM4P67936 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TPM4P67936 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TPM4P67936 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TPM4P67936 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TPM4P67936 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TPM4P67936 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TPM4P67936 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TPM4P67936 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TPM4P67936 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TPM4P67936 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TPM4P67936 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TPM4P67936 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TPM4P67936 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TPM4P67936 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TPM4P67936 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TPM4P67936 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TPM4P67936 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TPM4P67936 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TPM4P67936 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TPM4P67936 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TPM4P67936 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TPM4P67936 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TPM4P67936 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TPM4P67936 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TPM4P67936 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TPM4P67936 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TPM4P67936 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TPM4P67936 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TPM4P67936 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TPM4P67936 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TPM4P67936 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TPM4P67936 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TPM4P67936 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TPM4P67936 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TPM4P67936 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TPM4P67936 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TPM4P67936 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TPM4P67936 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TPM4P67936 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TPM4P67936 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TPM4P67936 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TPM4P67936 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TPM4P67936 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TPM4P67936 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TPM4P67936 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TPM4P67936 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TPM4P67936 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TPM4P67936 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TPM4P67936 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TPM4P67936 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TPM4P67936 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TPM4P67936 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TPM4P67936 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TPM4P67936 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TPM4P67936 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TPM4P67936 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TPM4P67936 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TPM4P67936 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TPM4P67936 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TPM4P67936 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TPM4P67936 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TPM4P67936 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TPM4P67936 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TPM4P67936 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms