Protein–RNA interactions for Protein: P63261

ACTG1, Actin, cytoplasmic 2, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTG1P63261 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTG1P63261 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTG1P63261 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTG1P63261 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTG1P63261 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTG1P63261 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ACTG1P63261 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
ACTG1P63261 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTG1P63261 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTG1P63261 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTG1P63261 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTG1P63261 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTG1P63261 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTG1P63261 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTG1P63261 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTG1P63261 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTG1P63261 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTG1P63261 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTG1P63261 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTG1P63261 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTG1P63261 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTG1P63261 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTG1P63261 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTG1P63261 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTG1P63261 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTG1P63261 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTG1P63261 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTG1P63261 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTG1P63261 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTG1P63261 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTG1P63261 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTG1P63261 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTG1P63261 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTG1P63261 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTG1P63261 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTG1P63261 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTG1P63261 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTG1P63261 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTG1P63261 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTG1P63261 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTG1P63261 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTG1P63261 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTG1P63261 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTG1P63261 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTG1P63261 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTG1P63261 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTG1P63261 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTG1P63261 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTG1P63261 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTG1P63261 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTG1P63261 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTG1P63261 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTG1P63261 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTG1P63261 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTG1P63261 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTG1P63261 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTG1P63261 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTG1P63261 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTG1P63261 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTG1P63261 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTG1P63261 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTG1P63261 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTG1P63261 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTG1P63261 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTG1P63261 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTG1P63261 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTG1P63261 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTG1P63261 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTG1P63261 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTG1P63261 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTG1P63261 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTG1P63261 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTG1P63261 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTG1P63261 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTG1P63261 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTG1P63261 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTG1P63261 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTG1P63261 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTG1P63261 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTG1P63261 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTG1P63261 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTG1P63261 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTG1P63261 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTG1P63261 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTG1P63261 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTG1P63261 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTG1P63261 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTG1P63261 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTG1P63261 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTG1P63261 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTG1P63261 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTG1P63261 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTG1P63261 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTG1P63261 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTG1P63261 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTG1P63261 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTG1P63261 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTG1P63261 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTG1P63261 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTG1P63261 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms