Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMO4P61968 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMO4P61968 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMO4P61968 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMO4P61968 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMO4P61968 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMO4P61968 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMO4P61968 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMO4P61968 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMO4P61968 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMO4P61968 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMO4P61968 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMO4P61968 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMO4P61968 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMO4P61968 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMO4P61968 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMO4P61968 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMO4P61968 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMO4P61968 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMO4P61968 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMO4P61968 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMO4P61968 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMO4P61968 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
LMO4P61968 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMO4P61968 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMO4P61968 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMO4P61968 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMO4P61968 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LMO4P61968 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LMO4P61968 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LMO4P61968 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LMO4P61968 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LMO4P61968 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
LMO4P61968 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LMO4P61968 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LMO4P61968 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
LMO4P61968 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LMO4P61968 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LMO4P61968 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LMO4P61968 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LMO4P61968 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMO4P61968 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMO4P61968 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMO4P61968 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMO4P61968 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMO4P61968 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
LMO4P61968 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMO4P61968 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
LMO4P61968 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMO4P61968 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMO4P61968 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMO4P61968 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMO4P61968 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
LMO4P61968 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMO4P61968 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMO4P61968 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMO4P61968 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMO4P61968 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMO4P61968 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMO4P61968 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMO4P61968 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMO4P61968 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMO4P61968 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LMO4P61968 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LMO4P61968 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LMO4P61968 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LMO4P61968 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LMO4P61968 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LMO4P61968 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LMO4P61968 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LMO4P61968 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
LMO4P61968 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
LMO4P61968 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LMO4P61968 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LMO4P61968 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LMO4P61968 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LMO4P61968 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LMO4P61968 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LMO4P61968 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LMO4P61968 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LMO4P61968 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LMO4P61968 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
LMO4P61968 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LMO4P61968 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LMO4P61968 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMO4P61968 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMO4P61968 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMO4P61968 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMO4P61968 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMO4P61968 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMO4P61968 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMO4P61968 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
LMO4P61968 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMO4P61968 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMO4P61968 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMO4P61968 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMO4P61968 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMO4P61968 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMO4P61968 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMO4P61968 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms