Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UFM1P61960 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UFM1P61960 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UFM1P61960 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UFM1P61960 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UFM1P61960 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
UFM1P61960 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UFM1P61960 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UFM1P61960 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UFM1P61960 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UFM1P61960 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UFM1P61960 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UFM1P61960 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
UFM1P61960 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UFM1P61960 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UFM1P61960 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UFM1P61960 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UFM1P61960 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UFM1P61960 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UFM1P61960 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UFM1P61960 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UFM1P61960 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UFM1P61960 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UFM1P61960 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UFM1P61960 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UFM1P61960 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UFM1P61960 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UFM1P61960 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
UFM1P61960 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UFM1P61960 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UFM1P61960 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UFM1P61960 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UFM1P61960 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UFM1P61960 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UFM1P61960 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UFM1P61960 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
UFM1P61960 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UFM1P61960 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UFM1P61960 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UFM1P61960 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UFM1P61960 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UFM1P61960 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UFM1P61960 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UFM1P61960 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UFM1P61960 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UFM1P61960 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UFM1P61960 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UFM1P61960 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UFM1P61960 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UFM1P61960 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UFM1P61960 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UFM1P61960 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
UFM1P61960 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UFM1P61960 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UFM1P61960 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UFM1P61960 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UFM1P61960 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UFM1P61960 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
UFM1P61960 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UFM1P61960 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UFM1P61960 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UFM1P61960 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UFM1P61960 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UFM1P61960 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UFM1P61960 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UFM1P61960 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UFM1P61960 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UFM1P61960 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UFM1P61960 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UFM1P61960 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
UFM1P61960 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UFM1P61960 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UFM1P61960 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UFM1P61960 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UFM1P61960 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
UFM1P61960 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UFM1P61960 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
UFM1P61960 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
UFM1P61960 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
UFM1P61960 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UFM1P61960 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
UFM1P61960 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
UFM1P61960 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
UFM1P61960 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
UFM1P61960 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
UFM1P61960 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
UFM1P61960 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
UFM1P61960 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UFM1P61960 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UFM1P61960 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UFM1P61960 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
UFM1P61960 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UFM1P61960 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UFM1P61960 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UFM1P61960 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UFM1P61960 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UFM1P61960 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UFM1P61960 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UFM1P61960 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
UFM1P61960 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms