Protein–RNA interactions for Protein: P61576

HERV-K104, Endogenous retrovirus group K member 104 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERV-K104P61576 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms