Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVS71-1P61550 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVS71-1P61550 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVS71-1P61550 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVS71-1P61550 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVS71-1P61550 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVS71-1P61550 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVS71-1P61550 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVS71-1P61550 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVS71-1P61550 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVS71-1P61550 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVS71-1P61550 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVS71-1P61550 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVS71-1P61550 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVS71-1P61550 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVS71-1P61550 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVS71-1P61550 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVS71-1P61550 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVS71-1P61550 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVS71-1P61550 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVS71-1P61550 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVS71-1P61550 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVS71-1P61550 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVS71-1P61550 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVS71-1P61550 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVS71-1P61550 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVS71-1P61550 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVS71-1P61550 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVS71-1P61550 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVS71-1P61550 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVS71-1P61550 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVS71-1P61550 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVS71-1P61550 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVS71-1P61550 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVS71-1P61550 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVS71-1P61550 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVS71-1P61550 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVS71-1P61550 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVS71-1P61550 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVS71-1P61550 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVS71-1P61550 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVS71-1P61550 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVS71-1P61550 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVS71-1P61550 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVS71-1P61550 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVS71-1P61550 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVS71-1P61550 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVS71-1P61550 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVS71-1P61550 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVS71-1P61550 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVS71-1P61550 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVS71-1P61550 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVS71-1P61550 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVS71-1P61550 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVS71-1P61550 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVS71-1P61550 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVS71-1P61550 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVS71-1P61550 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVS71-1P61550 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVS71-1P61550 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVS71-1P61550 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVS71-1P61550 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVS71-1P61550 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVS71-1P61550 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVS71-1P61550 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVS71-1P61550 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVS71-1P61550 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVS71-1P61550 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVS71-1P61550 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVS71-1P61550 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVS71-1P61550 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVS71-1P61550 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVS71-1P61550 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVS71-1P61550 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVS71-1P61550 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVS71-1P61550 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVS71-1P61550 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVS71-1P61550 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVS71-1P61550 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVS71-1P61550 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVS71-1P61550 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVS71-1P61550 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVS71-1P61550 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVS71-1P61550 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVS71-1P61550 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVS71-1P61550 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVS71-1P61550 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVS71-1P61550 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVS71-1P61550 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVS71-1P61550 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVS71-1P61550 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVS71-1P61550 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVS71-1P61550 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVS71-1P61550 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVS71-1P61550 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVS71-1P61550 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVS71-1P61550 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVS71-1P61550 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVS71-1P61550 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVS71-1P61550 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms