Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBASH3AP57075 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
UBASH3AP57075 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBASH3AP57075 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBASH3AP57075 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBASH3AP57075 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBASH3AP57075 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBASH3AP57075 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBASH3AP57075 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBASH3AP57075 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBASH3AP57075 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBASH3AP57075 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBASH3AP57075 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
UBASH3AP57075 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBASH3AP57075 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBASH3AP57075 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBASH3AP57075 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBASH3AP57075 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBASH3AP57075 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBASH3AP57075 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBASH3AP57075 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBASH3AP57075 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBASH3AP57075 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBASH3AP57075 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBASH3AP57075 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
UBASH3AP57075 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBASH3AP57075 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBASH3AP57075 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBASH3AP57075 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBASH3AP57075 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
UBASH3AP57075 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
UBASH3AP57075 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBASH3AP57075 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBASH3AP57075 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBASH3AP57075 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBASH3AP57075 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBASH3AP57075 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBASH3AP57075 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBASH3AP57075 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBASH3AP57075 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBASH3AP57075 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBASH3AP57075 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBASH3AP57075 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBASH3AP57075 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBASH3AP57075 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBASH3AP57075 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBASH3AP57075 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBASH3AP57075 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBASH3AP57075 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBASH3AP57075 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBASH3AP57075 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBASH3AP57075 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBASH3AP57075 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBASH3AP57075 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBASH3AP57075 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBASH3AP57075 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBASH3AP57075 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBASH3AP57075 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBASH3AP57075 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBASH3AP57075 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBASH3AP57075 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
UBASH3AP57075 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBASH3AP57075 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBASH3AP57075 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBASH3AP57075 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBASH3AP57075 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
UBASH3AP57075 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
UBASH3AP57075 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBASH3AP57075 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBASH3AP57075 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBASH3AP57075 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBASH3AP57075 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBASH3AP57075 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBASH3AP57075 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBASH3AP57075 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBASH3AP57075 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBASH3AP57075 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBASH3AP57075 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBASH3AP57075 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBASH3AP57075 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBASH3AP57075 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
UBASH3AP57075 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBASH3AP57075 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBASH3AP57075 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
UBASH3AP57075 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBASH3AP57075 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBASH3AP57075 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBASH3AP57075 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBASH3AP57075 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBASH3AP57075 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBASH3AP57075 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBASH3AP57075 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBASH3AP57075 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBASH3AP57075 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBASH3AP57075 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBASH3AP57075 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBASH3AP57075 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
UBASH3AP57075 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBASH3AP57075 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBASH3AP57075 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms