Protein–RNA interactions for Protein: P56915

GSC, Homeobox protein goosecoid, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSCP56915 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GSCP56915 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GSCP56915 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GSCP56915 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GSCP56915 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GSCP56915 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GSCP56915 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GSCP56915 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GSCP56915 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GSCP56915 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GSCP56915 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GSCP56915 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GSCP56915 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GSCP56915 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GSCP56915 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GSCP56915 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GSCP56915 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GSCP56915 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GSCP56915 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GSCP56915 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GSCP56915 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GSCP56915 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GSCP56915 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GSCP56915 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GSCP56915 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GSCP56915 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GSCP56915 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GSCP56915 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GSCP56915 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GSCP56915 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GSCP56915 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GSCP56915 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GSCP56915 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GSCP56915 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GSCP56915 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GSCP56915 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GSCP56915 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GSCP56915 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GSCP56915 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GSCP56915 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GSCP56915 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GSCP56915 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GSCP56915 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GSCP56915 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GSCP56915 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GSCP56915 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GSCP56915 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GSCP56915 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GSCP56915 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GSCP56915 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GSCP56915 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GSCP56915 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GSCP56915 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GSCP56915 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GSCP56915 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GSCP56915 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GSCP56915 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GSCP56915 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GSCP56915 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GSCP56915 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GSCP56915 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GSCP56915 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GSCP56915 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GSCP56915 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GSCP56915 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GSCP56915 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GSCP56915 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GSCP56915 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GSCP56915 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GSCP56915 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GSCP56915 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GSCP56915 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GSCP56915 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GSCP56915 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GSCP56915 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GSCP56915 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GSCP56915 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GSCP56915 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GSCP56915 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GSCP56915 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GSCP56915 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GSCP56915 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GSCP56915 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GSCP56915 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GSCP56915 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GSCP56915 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GSCP56915 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GSCP56915 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GSCP56915 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GSCP56915 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GSCP56915 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GSCP56915 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GSCP56915 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GSCP56915 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GSCP56915 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GSCP56915 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GSCP56915 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GSCP56915 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GSCP56915 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GSCP56915 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms