Protein–RNA interactions for Protein: P56202

CTSW, Cathepsin W, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSWP56202 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CTSWP56202 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CTSWP56202 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CTSWP56202 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CTSWP56202 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CTSWP56202 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CTSWP56202 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CTSWP56202 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CTSWP56202 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CTSWP56202 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTSWP56202 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTSWP56202 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTSWP56202 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTSWP56202 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTSWP56202 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTSWP56202 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTSWP56202 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CTSWP56202 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CTSWP56202 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CTSWP56202 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTSWP56202 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTSWP56202 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTSWP56202 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTSWP56202 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTSWP56202 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTSWP56202 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTSWP56202 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTSWP56202 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTSWP56202 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTSWP56202 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTSWP56202 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTSWP56202 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CTSWP56202 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTSWP56202 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CTSWP56202 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CTSWP56202 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CTSWP56202 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CTSWP56202 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CTSWP56202 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CTSWP56202 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CTSWP56202 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CTSWP56202 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CTSWP56202 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CTSWP56202 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CTSWP56202 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CTSWP56202 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CTSWP56202 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CTSWP56202 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CTSWP56202 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CTSWP56202 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CTSWP56202 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CTSWP56202 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
CTSWP56202 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
CTSWP56202 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CTSWP56202 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CTSWP56202 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CTSWP56202 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CTSWP56202 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CTSWP56202 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CTSWP56202 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CTSWP56202 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CTSWP56202 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CTSWP56202 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CTSWP56202 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CTSWP56202 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CTSWP56202 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CTSWP56202 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CTSWP56202 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CTSWP56202 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CTSWP56202 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CTSWP56202 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CTSWP56202 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CTSWP56202 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CTSWP56202 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CTSWP56202 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CTSWP56202 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CTSWP56202 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CTSWP56202 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CTSWP56202 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CTSWP56202 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CTSWP56202 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CTSWP56202 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CTSWP56202 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTSWP56202 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTSWP56202 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTSWP56202 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTSWP56202 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTSWP56202 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTSWP56202 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTSWP56202 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CTSWP56202 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTSWP56202 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTSWP56202 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTSWP56202 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTSWP56202 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTSWP56202 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTSWP56202 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTSWP56202 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTSWP56202 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTSWP56202 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms