Protein–RNA interactions for Protein: P55072

VCP, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPP55072 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VCPP55072 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
VCPP55072 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VCPP55072 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VCPP55072 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
VCPP55072 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VCPP55072 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VCPP55072 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VCPP55072 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VCPP55072 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VCPP55072 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VCPP55072 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VCPP55072 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VCPP55072 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VCPP55072 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VCPP55072 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VCPP55072 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VCPP55072 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VCPP55072 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VCPP55072 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VCPP55072 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VCPP55072 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
VCPP55072 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VCPP55072 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VCPP55072 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VCPP55072 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VCPP55072 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VCPP55072 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VCPP55072 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VCPP55072 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VCPP55072 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VCPP55072 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VCPP55072 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
VCPP55072 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
VCPP55072 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
VCPP55072 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
VCPP55072 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VCPP55072 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VCPP55072 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VCPP55072 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VCPP55072 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VCPP55072 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
VCPP55072 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VCPP55072 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VCPP55072 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VCPP55072 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VCPP55072 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VCPP55072 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VCPP55072 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VCPP55072 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VCPP55072 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VCPP55072 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VCPP55072 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VCPP55072 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VCPP55072 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VCPP55072 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VCPP55072 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VCPP55072 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VCPP55072 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VCPP55072 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VCPP55072 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
VCPP55072 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VCPP55072 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VCPP55072 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VCPP55072 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VCPP55072 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VCPP55072 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VCPP55072 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VCPP55072 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VCPP55072 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VCPP55072 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VCPP55072 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VCPP55072 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
VCPP55072 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VCPP55072 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VCPP55072 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VCPP55072 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VCPP55072 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VCPP55072 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VCPP55072 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VCPP55072 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
VCPP55072 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VCPP55072 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VCPP55072 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VCPP55072 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VCPP55072 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VCPP55072 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VCPP55072 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VCPP55072 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VCPP55072 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VCPP55072 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VCPP55072 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VCPP55072 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
VCPP55072 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
VCPP55072 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VCPP55072 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VCPP55072 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VCPP55072 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VCPP55072 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VCPP55072 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms