Protein–RNA interactions for Protein: P55056

APOC4, Apolipoprotein C-IV, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4P55056 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC4P55056 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC4P55056 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC4P55056 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC4P55056 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC4P55056 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC4P55056 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC4P55056 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC4P55056 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC4P55056 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC4P55056 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC4P55056 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC4P55056 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC4P55056 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC4P55056 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC4P55056 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC4P55056 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC4P55056 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC4P55056 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC4P55056 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC4P55056 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC4P55056 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC4P55056 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC4P55056 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC4P55056 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC4P55056 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC4P55056 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC4P55056 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC4P55056 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOC4P55056 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOC4P55056 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
APOC4P55056 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOC4P55056 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOC4P55056 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOC4P55056 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOC4P55056 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOC4P55056 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOC4P55056 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOC4P55056 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOC4P55056 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOC4P55056 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOC4P55056 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
APOC4P55056 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
APOC4P55056 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOC4P55056 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOC4P55056 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
APOC4P55056 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
APOC4P55056 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
APOC4P55056 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOC4P55056 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOC4P55056 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOC4P55056 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOC4P55056 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOC4P55056 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOC4P55056 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOC4P55056 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOC4P55056 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOC4P55056 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOC4P55056 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
APOC4P55056 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
APOC4P55056 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOC4P55056 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOC4P55056 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
APOC4P55056 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOC4P55056 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOC4P55056 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
APOC4P55056 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOC4P55056 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
APOC4P55056 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOC4P55056 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOC4P55056 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOC4P55056 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOC4P55056 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOC4P55056 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOC4P55056 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOC4P55056 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOC4P55056 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
APOC4P55056 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOC4P55056 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOC4P55056 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOC4P55056 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOC4P55056 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOC4P55056 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOC4P55056 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOC4P55056 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOC4P55056 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOC4P55056 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOC4P55056 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
APOC4P55056 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOC4P55056 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOC4P55056 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
APOC4P55056 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOC4P55056 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOC4P55056 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
APOC4P55056 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOC4P55056 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOC4P55056 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOC4P55056 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOC4P55056 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOC4P55056 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms