Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAD23AP54725 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAD23AP54725 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAD23AP54725 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAD23AP54725 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAD23AP54725 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAD23AP54725 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAD23AP54725 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAD23AP54725 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAD23AP54725 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAD23AP54725 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAD23AP54725 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAD23AP54725 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAD23AP54725 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAD23AP54725 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAD23AP54725 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAD23AP54725 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAD23AP54725 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAD23AP54725 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAD23AP54725 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAD23AP54725 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAD23AP54725 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAD23AP54725 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAD23AP54725 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAD23AP54725 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAD23AP54725 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAD23AP54725 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
RAD23AP54725 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
RAD23AP54725 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
RAD23AP54725 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAD23AP54725 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAD23AP54725 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAD23AP54725 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAD23AP54725 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAD23AP54725 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAD23AP54725 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAD23AP54725 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAD23AP54725 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RAD23AP54725 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
RAD23AP54725 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RAD23AP54725 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RAD23AP54725 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RAD23AP54725 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RAD23AP54725 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RAD23AP54725 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RAD23AP54725 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RAD23AP54725 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RAD23AP54725 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RAD23AP54725 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RAD23AP54725 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RAD23AP54725 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RAD23AP54725 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RAD23AP54725 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RAD23AP54725 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RAD23AP54725 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RAD23AP54725 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RAD23AP54725 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RAD23AP54725 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RAD23AP54725 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RAD23AP54725 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RAD23AP54725 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RAD23AP54725 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RAD23AP54725 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RAD23AP54725 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RAD23AP54725 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RAD23AP54725 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RAD23AP54725 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RAD23AP54725 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RAD23AP54725 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RAD23AP54725 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
RAD23AP54725 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RAD23AP54725 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RAD23AP54725 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RAD23AP54725 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RAD23AP54725 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RAD23AP54725 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RAD23AP54725 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RAD23AP54725 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RAD23AP54725 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RAD23AP54725 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RAD23AP54725 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RAD23AP54725 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RAD23AP54725 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RAD23AP54725 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RAD23AP54725 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RAD23AP54725 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RAD23AP54725 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RAD23AP54725 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RAD23AP54725 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
RAD23AP54725 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RAD23AP54725 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RAD23AP54725 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RAD23AP54725 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RAD23AP54725 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RAD23AP54725 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RAD23AP54725 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RAD23AP54725 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RAD23AP54725 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RAD23AP54725 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RAD23AP54725 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms