Protein–RNA interactions for Protein: P53396

ACLY, ATP-citrate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACLYP53396 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACLYP53396 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ACLYP53396 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACLYP53396 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACLYP53396 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACLYP53396 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACLYP53396 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACLYP53396 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACLYP53396 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACLYP53396 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACLYP53396 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACLYP53396 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ACLYP53396 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ACLYP53396 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACLYP53396 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACLYP53396 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACLYP53396 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACLYP53396 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACLYP53396 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACLYP53396 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACLYP53396 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACLYP53396 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACLYP53396 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACLYP53396 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ACLYP53396 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACLYP53396 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACLYP53396 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACLYP53396 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACLYP53396 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACLYP53396 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACLYP53396 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACLYP53396 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACLYP53396 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACLYP53396 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACLYP53396 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACLYP53396 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACLYP53396 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACLYP53396 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACLYP53396 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ACLYP53396 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACLYP53396 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ACLYP53396 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACLYP53396 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACLYP53396 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACLYP53396 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACLYP53396 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
ACLYP53396 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACLYP53396 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACLYP53396 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACLYP53396 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACLYP53396 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACLYP53396 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ACLYP53396 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACLYP53396 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACLYP53396 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACLYP53396 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ACLYP53396 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACLYP53396 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACLYP53396 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACLYP53396 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACLYP53396 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACLYP53396 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACLYP53396 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACLYP53396 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACLYP53396 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACLYP53396 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACLYP53396 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACLYP53396 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACLYP53396 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACLYP53396 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACLYP53396 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACLYP53396 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACLYP53396 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACLYP53396 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACLYP53396 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACLYP53396 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACLYP53396 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACLYP53396 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACLYP53396 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACLYP53396 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACLYP53396 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACLYP53396 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACLYP53396 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACLYP53396 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACLYP53396 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACLYP53396 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACLYP53396 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACLYP53396 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACLYP53396 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACLYP53396 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACLYP53396 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ACLYP53396 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACLYP53396 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACLYP53396 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACLYP53396 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACLYP53396 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ACLYP53396 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACLYP53396 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ACLYP53396 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACLYP53396 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms