Protein–RNA interactions for Protein: P52952

NKX2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-5P52952 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NKX2-5P52952 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NKX2-5P52952 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NKX2-5P52952 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NKX2-5P52952 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NKX2-5P52952 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NKX2-5P52952 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NKX2-5P52952 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NKX2-5P52952 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NKX2-5P52952 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NKX2-5P52952 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NKX2-5P52952 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NKX2-5P52952 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NKX2-5P52952 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NKX2-5P52952 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NKX2-5P52952 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NKX2-5P52952 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NKX2-5P52952 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NKX2-5P52952 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NKX2-5P52952 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NKX2-5P52952 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NKX2-5P52952 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NKX2-5P52952 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NKX2-5P52952 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NKX2-5P52952 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NKX2-5P52952 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NKX2-5P52952 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NKX2-5P52952 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NKX2-5P52952 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NKX2-5P52952 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NKX2-5P52952 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
NKX2-5P52952 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NKX2-5P52952 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NKX2-5P52952 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NKX2-5P52952 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NKX2-5P52952 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NKX2-5P52952 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NKX2-5P52952 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NKX2-5P52952 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NKX2-5P52952 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NKX2-5P52952 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKX2-5P52952 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKX2-5P52952 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKX2-5P52952 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKX2-5P52952 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKX2-5P52952 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKX2-5P52952 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKX2-5P52952 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKX2-5P52952 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKX2-5P52952 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKX2-5P52952 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKX2-5P52952 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKX2-5P52952 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKX2-5P52952 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKX2-5P52952 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKX2-5P52952 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKX2-5P52952 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKX2-5P52952 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKX2-5P52952 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKX2-5P52952 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKX2-5P52952 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKX2-5P52952 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKX2-5P52952 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKX2-5P52952 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKX2-5P52952 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKX2-5P52952 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKX2-5P52952 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKX2-5P52952 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKX2-5P52952 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKX2-5P52952 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKX2-5P52952 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKX2-5P52952 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKX2-5P52952 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKX2-5P52952 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKX2-5P52952 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKX2-5P52952 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKX2-5P52952 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKX2-5P52952 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKX2-5P52952 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKX2-5P52952 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKX2-5P52952 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKX2-5P52952 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKX2-5P52952 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKX2-5P52952 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKX2-5P52952 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKX2-5P52952 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKX2-5P52952 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NKX2-5P52952 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NKX2-5P52952 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NKX2-5P52952 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NKX2-5P52952 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NKX2-5P52952 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NKX2-5P52952 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NKX2-5P52952 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NKX2-5P52952 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NKX2-5P52952 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NKX2-5P52952 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NKX2-5P52952 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NKX2-5P52952 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NKX2-5P52952 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms