Protein–RNA interactions for Protein: P52948

NUP98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, humanhuman

Predictions only

Length 1,817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP98P52948 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NUP98P52948 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NUP98P52948 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NUP98P52948 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NUP98P52948 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NUP98P52948 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NUP98P52948 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
NUP98P52948 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NUP98P52948 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NUP98P52948 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NUP98P52948 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NUP98P52948 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NUP98P52948 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NUP98P52948 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NUP98P52948 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NUP98P52948 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
NUP98P52948 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NUP98P52948 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NUP98P52948 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NUP98P52948 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NUP98P52948 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NUP98P52948 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NUP98P52948 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NUP98P52948 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NUP98P52948 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NUP98P52948 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NUP98P52948 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NUP98P52948 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NUP98P52948 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NUP98P52948 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
NUP98P52948 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NUP98P52948 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NUP98P52948 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NUP98P52948 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NUP98P52948 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NUP98P52948 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NUP98P52948 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NUP98P52948 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NUP98P52948 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NUP98P52948 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NUP98P52948 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
NUP98P52948 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NUP98P52948 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NUP98P52948 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NUP98P52948 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NUP98P52948 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NUP98P52948 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NUP98P52948 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NUP98P52948 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NUP98P52948 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NUP98P52948 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NUP98P52948 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
NUP98P52948 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NUP98P52948 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NUP98P52948 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NUP98P52948 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NUP98P52948 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
NUP98P52948 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NUP98P52948 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NUP98P52948 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NUP98P52948 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NUP98P52948 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NUP98P52948 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NUP98P52948 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NUP98P52948 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NUP98P52948 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NUP98P52948 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NUP98P52948 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NUP98P52948 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NUP98P52948 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NUP98P52948 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NUP98P52948 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
NUP98P52948 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
NUP98P52948 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NUP98P52948 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NUP98P52948 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NUP98P52948 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NUP98P52948 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
NUP98P52948 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NUP98P52948 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NUP98P52948 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NUP98P52948 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NUP98P52948 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NUP98P52948 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NUP98P52948 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NUP98P52948 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NUP98P52948 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NUP98P52948 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NUP98P52948 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NUP98P52948 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NUP98P52948 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NUP98P52948 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NUP98P52948 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NUP98P52948 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NUP98P52948 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NUP98P52948 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NUP98P52948 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NUP98P52948 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NUP98P52948 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NUP98P52948 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms