Protein–RNA interactions for Protein: P51861

CDR1, Cerebellar degeneration-related antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR1P51861 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDR1P51861 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDR1P51861 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDR1P51861 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDR1P51861 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDR1P51861 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDR1P51861 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDR1P51861 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDR1P51861 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDR1P51861 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDR1P51861 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDR1P51861 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDR1P51861 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDR1P51861 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDR1P51861 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDR1P51861 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDR1P51861 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDR1P51861 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDR1P51861 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDR1P51861 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDR1P51861 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDR1P51861 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDR1P51861 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDR1P51861 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDR1P51861 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDR1P51861 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDR1P51861 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDR1P51861 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDR1P51861 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDR1P51861 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CDR1P51861 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDR1P51861 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDR1P51861 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDR1P51861 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDR1P51861 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDR1P51861 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDR1P51861 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDR1P51861 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDR1P51861 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDR1P51861 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDR1P51861 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDR1P51861 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDR1P51861 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDR1P51861 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CDR1P51861 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDR1P51861 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDR1P51861 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDR1P51861 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDR1P51861 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDR1P51861 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDR1P51861 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDR1P51861 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDR1P51861 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CDR1P51861 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDR1P51861 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDR1P51861 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CDR1P51861 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDR1P51861 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDR1P51861 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDR1P51861 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDR1P51861 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDR1P51861 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CDR1P51861 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDR1P51861 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDR1P51861 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDR1P51861 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDR1P51861 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDR1P51861 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDR1P51861 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDR1P51861 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDR1P51861 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CDR1P51861 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDR1P51861 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDR1P51861 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDR1P51861 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDR1P51861 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDR1P51861 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDR1P51861 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDR1P51861 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDR1P51861 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDR1P51861 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDR1P51861 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDR1P51861 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDR1P51861 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CDR1P51861 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDR1P51861 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDR1P51861 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDR1P51861 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CDR1P51861 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CDR1P51861 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CDR1P51861 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDR1P51861 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDR1P51861 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CDR1P51861 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDR1P51861 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDR1P51861 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDR1P51861 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDR1P51861 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDR1P51861 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDR1P51861 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms