Protein–RNA interactions for Protein: P51801

CLCNKB, Chloride channel protein ClC-Kb, humanhuman

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCNKBP51801 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLCNKBP51801 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLCNKBP51801 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLCNKBP51801 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLCNKBP51801 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLCNKBP51801 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLCNKBP51801 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLCNKBP51801 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLCNKBP51801 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CLCNKBP51801 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLCNKBP51801 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLCNKBP51801 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLCNKBP51801 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLCNKBP51801 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLCNKBP51801 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLCNKBP51801 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLCNKBP51801 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLCNKBP51801 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLCNKBP51801 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CLCNKBP51801 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLCNKBP51801 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLCNKBP51801 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLCNKBP51801 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLCNKBP51801 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLCNKBP51801 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLCNKBP51801 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLCNKBP51801 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLCNKBP51801 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLCNKBP51801 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLCNKBP51801 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLCNKBP51801 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLCNKBP51801 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLCNKBP51801 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CLCNKBP51801 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CLCNKBP51801 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLCNKBP51801 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CLCNKBP51801 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLCNKBP51801 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLCNKBP51801 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLCNKBP51801 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLCNKBP51801 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CLCNKBP51801 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLCNKBP51801 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLCNKBP51801 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLCNKBP51801 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLCNKBP51801 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLCNKBP51801 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLCNKBP51801 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLCNKBP51801 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLCNKBP51801 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLCNKBP51801 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLCNKBP51801 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLCNKBP51801 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLCNKBP51801 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLCNKBP51801 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLCNKBP51801 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLCNKBP51801 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLCNKBP51801 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CLCNKBP51801 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLCNKBP51801 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLCNKBP51801 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CLCNKBP51801 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLCNKBP51801 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLCNKBP51801 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLCNKBP51801 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CLCNKBP51801 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLCNKBP51801 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLCNKBP51801 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLCNKBP51801 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLCNKBP51801 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLCNKBP51801 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLCNKBP51801 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLCNKBP51801 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLCNKBP51801 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLCNKBP51801 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CLCNKBP51801 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLCNKBP51801 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CLCNKBP51801 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLCNKBP51801 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLCNKBP51801 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLCNKBP51801 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLCNKBP51801 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLCNKBP51801 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLCNKBP51801 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLCNKBP51801 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CLCNKBP51801 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLCNKBP51801 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CLCNKBP51801 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLCNKBP51801 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLCNKBP51801 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CLCNKBP51801 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLCNKBP51801 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLCNKBP51801 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLCNKBP51801 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLCNKBP51801 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLCNKBP51801 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLCNKBP51801 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLCNKBP51801 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLCNKBP51801 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLCNKBP51801 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms