Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
SMARCA4P51532 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
SMARCA4P51532 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC38.04■■■■□ 3.68
SMARCA4P51532 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
SMARCA4P51532 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
SMARCA4P51532 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.03■■■■□ 3.68
SMARCA4P51532 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC38.03■■■■□ 3.68
SMARCA4P51532 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
SMARCA4P51532 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
SMARCA4P51532 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
SMARCA4P51532 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC38.02■■■■□ 3.68
SMARCA4P51532 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
SMARCA4P51532 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.02■■■■□ 3.68
SMARCA4P51532 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
SMARCA4P51532 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
SMARCA4P51532 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC38.01■■■■□ 3.68
SMARCA4P51532 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC38.01■■■■□ 3.68
SMARCA4P51532 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.68
SMARCA4P51532 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.68
SMARCA4P51532 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
SMARCA4P51532 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC38.01■■■■□ 3.67
SMARCA4P51532 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.67
SMARCA4P51532 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.01■■■■□ 3.67
SMARCA4P51532 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC38■■■■□ 3.67
SMARCA4P51532 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC38■■■■□ 3.67
SMARCA4P51532 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC38■■■■□ 3.67
SMARCA4P51532 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
SMARCA4P51532 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
SMARCA4P51532 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC38■■■■□ 3.67
SMARCA4P51532 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC38■■■■□ 3.67
SMARCA4P51532 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC38■■■■□ 3.67
SMARCA4P51532 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
SMARCA4P51532 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.99■■■■□ 3.67
SMARCA4P51532 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
SMARCA4P51532 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
SMARCA4P51532 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
SMARCA4P51532 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
SMARCA4P51532 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
SMARCA4P51532 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC37.99■■■■□ 3.67
SMARCA4P51532 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
SMARCA4P51532 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
SMARCA4P51532 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
SMARCA4P51532 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
SMARCA4P51532 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC37.98■■■■□ 3.67
SMARCA4P51532 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC37.98■■■■□ 3.67
SMARCA4P51532 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC37.98■■■■□ 3.67
SMARCA4P51532 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
SMARCA4P51532 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
SMARCA4P51532 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
SMARCA4P51532 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC37.98■■■■□ 3.67
SMARCA4P51532 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
SMARCA4P51532 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC37.98■■■■□ 3.67
SMARCA4P51532 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
SMARCA4P51532 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
SMARCA4P51532 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC37.98■■■■□ 3.67
SMARCA4P51532 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC37.98■■■■□ 3.67
SMARCA4P51532 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
SMARCA4P51532 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC37.98■■■■□ 3.67
SMARCA4P51532 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
SMARCA4P51532 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
SMARCA4P51532 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
SMARCA4P51532 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
SMARCA4P51532 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
SMARCA4P51532 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
SMARCA4P51532 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
SMARCA4P51532 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
SMARCA4P51532 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
SMARCA4P51532 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC37.97■■■■□ 3.67
SMARCA4P51532 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
SMARCA4P51532 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
SMARCA4P51532 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
SMARCA4P51532 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
SMARCA4P51532 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
SMARCA4P51532 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
SMARCA4P51532 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
SMARCA4P51532 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
SMARCA4P51532 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
SMARCA4P51532 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC37.96■■■■□ 3.67
SMARCA4P51532 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
SMARCA4P51532 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
SMARCA4P51532 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.95■■■■□ 3.67
SMARCA4P51532 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC37.95■■■■□ 3.67
SMARCA4P51532 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
SMARCA4P51532 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
SMARCA4P51532 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
SMARCA4P51532 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
SMARCA4P51532 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
SMARCA4P51532 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
SMARCA4P51532 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
SMARCA4P51532 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
SMARCA4P51532 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
SMARCA4P51532 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
SMARCA4P51532 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
SMARCA4P51532 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
SMARCA4P51532 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
SMARCA4P51532 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
SMARCA4P51532 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC37.94■■■■□ 3.66
SMARCA4P51532 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
SMARCA4P51532 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
SMARCA4P51532 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms