Protein–RNA interactions for Protein: P51160

PDE6C, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6CP51160 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE6CP51160 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE6CP51160 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE6CP51160 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE6CP51160 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE6CP51160 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE6CP51160 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE6CP51160 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE6CP51160 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE6CP51160 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE6CP51160 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE6CP51160 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE6CP51160 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE6CP51160 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE6CP51160 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE6CP51160 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE6CP51160 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE6CP51160 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE6CP51160 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE6CP51160 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE6CP51160 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE6CP51160 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE6CP51160 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE6CP51160 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE6CP51160 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE6CP51160 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE6CP51160 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE6CP51160 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE6CP51160 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE6CP51160 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE6CP51160 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE6CP51160 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE6CP51160 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE6CP51160 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE6CP51160 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE6CP51160 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE6CP51160 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE6CP51160 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE6CP51160 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE6CP51160 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE6CP51160 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE6CP51160 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE6CP51160 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE6CP51160 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE6CP51160 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE6CP51160 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE6CP51160 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE6CP51160 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE6CP51160 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE6CP51160 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE6CP51160 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PDE6CP51160 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDE6CP51160 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDE6CP51160 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PDE6CP51160 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDE6CP51160 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDE6CP51160 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDE6CP51160 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDE6CP51160 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDE6CP51160 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDE6CP51160 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDE6CP51160 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDE6CP51160 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDE6CP51160 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PDE6CP51160 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PDE6CP51160 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PDE6CP51160 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PDE6CP51160 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PDE6CP51160 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PDE6CP51160 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE6CP51160 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE6CP51160 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE6CP51160 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE6CP51160 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE6CP51160 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE6CP51160 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE6CP51160 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE6CP51160 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE6CP51160 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE6CP51160 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE6CP51160 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE6CP51160 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE6CP51160 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE6CP51160 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE6CP51160 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE6CP51160 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE6CP51160 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE6CP51160 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE6CP51160 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE6CP51160 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE6CP51160 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE6CP51160 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE6CP51160 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE6CP51160 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE6CP51160 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE6CP51160 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE6CP51160 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE6CP51160 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE6CP51160 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE6CP51160 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms