Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TAF6P49848 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TAF6P49848 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TAF6P49848 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TAF6P49848 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TAF6P49848 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TAF6P49848 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TAF6P49848 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TAF6P49848 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TAF6P49848 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TAF6P49848 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TAF6P49848 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TAF6P49848 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TAF6P49848 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TAF6P49848 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TAF6P49848 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TAF6P49848 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TAF6P49848 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TAF6P49848 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TAF6P49848 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TAF6P49848 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TAF6P49848 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TAF6P49848 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF6P49848 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF6P49848 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF6P49848 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF6P49848 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF6P49848 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF6P49848 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF6P49848 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF6P49848 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF6P49848 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF6P49848 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF6P49848 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF6P49848 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TAF6P49848 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TAF6P49848 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TAF6P49848 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TAF6P49848 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TAF6P49848 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TAF6P49848 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TAF6P49848 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TAF6P49848 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TAF6P49848 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF6P49848 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF6P49848 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF6P49848 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF6P49848 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF6P49848 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF6P49848 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF6P49848 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF6P49848 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF6P49848 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF6P49848 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF6P49848 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF6P49848 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF6P49848 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF6P49848 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF6P49848 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF6P49848 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF6P49848 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TAF6P49848 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TAF6P49848 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TAF6P49848 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TAF6P49848 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TAF6P49848 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TAF6P49848 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TAF6P49848 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TAF6P49848 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TAF6P49848 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TAF6P49848 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TAF6P49848 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TAF6P49848 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TAF6P49848 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TAF6P49848 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TAF6P49848 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TAF6P49848 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TAF6P49848 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TAF6P49848 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TAF6P49848 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TAF6P49848 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TAF6P49848 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TAF6P49848 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TAF6P49848 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TAF6P49848 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TAF6P49848 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TAF6P49848 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TAF6P49848 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TAF6P49848 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TAF6P49848 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TAF6P49848 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TAF6P49848 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TAF6P49848 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TAF6P49848 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TAF6P49848 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TAF6P49848 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TAF6P49848 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF6P49848 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF6P49848 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF6P49848 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms