Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FNTBP49356 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FNTBP49356 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FNTBP49356 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FNTBP49356 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FNTBP49356 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
FNTBP49356 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FNTBP49356 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FNTBP49356 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FNTBP49356 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FNTBP49356 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FNTBP49356 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FNTBP49356 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FNTBP49356 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FNTBP49356 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FNTBP49356 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FNTBP49356 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FNTBP49356 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FNTBP49356 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FNTBP49356 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FNTBP49356 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
FNTBP49356 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FNTBP49356 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FNTBP49356 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
FNTBP49356 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FNTBP49356 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
FNTBP49356 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FNTBP49356 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FNTBP49356 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FNTBP49356 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FNTBP49356 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FNTBP49356 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FNTBP49356 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FNTBP49356 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FNTBP49356 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FNTBP49356 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FNTBP49356 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FNTBP49356 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FNTBP49356 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FNTBP49356 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FNTBP49356 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FNTBP49356 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FNTBP49356 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FNTBP49356 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FNTBP49356 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FNTBP49356 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FNTBP49356 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FNTBP49356 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
FNTBP49356 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
FNTBP49356 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FNTBP49356 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FNTBP49356 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FNTBP49356 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FNTBP49356 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FNTBP49356 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
FNTBP49356 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
FNTBP49356 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
FNTBP49356 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FNTBP49356 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FNTBP49356 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
FNTBP49356 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FNTBP49356 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FNTBP49356 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FNTBP49356 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FNTBP49356 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
FNTBP49356 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
FNTBP49356 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
FNTBP49356 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
FNTBP49356 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21■□□□□ 0.95
FNTBP49356 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21■□□□□ 0.95
FNTBP49356 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FNTBP49356 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FNTBP49356 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FNTBP49356 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
FNTBP49356 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
FNTBP49356 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
FNTBP49356 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FNTBP49356 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
FNTBP49356 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
FNTBP49356 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
FNTBP49356 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FNTBP49356 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FNTBP49356 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FNTBP49356 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FNTBP49356 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FNTBP49356 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FNTBP49356 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FNTBP49356 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FNTBP49356 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FNTBP49356 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FNTBP49356 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FNTBP49356 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FNTBP49356 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FNTBP49356 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FNTBP49356 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FNTBP49356 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FNTBP49356 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FNTBP49356 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FNTBP49356 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FNTBP49356 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms