Protein–RNA interactions for Protein: P48742

LHX1, LIM/homeobox protein Lhx1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1P48742 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LHX1P48742 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LHX1P48742 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LHX1P48742 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LHX1P48742 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LHX1P48742 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LHX1P48742 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LHX1P48742 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LHX1P48742 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LHX1P48742 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LHX1P48742 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LHX1P48742 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LHX1P48742 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LHX1P48742 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LHX1P48742 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LHX1P48742 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LHX1P48742 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
LHX1P48742 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LHX1P48742 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LHX1P48742 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LHX1P48742 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LHX1P48742 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LHX1P48742 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LHX1P48742 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LHX1P48742 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LHX1P48742 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LHX1P48742 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LHX1P48742 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LHX1P48742 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LHX1P48742 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LHX1P48742 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LHX1P48742 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LHX1P48742 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LHX1P48742 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LHX1P48742 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LHX1P48742 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LHX1P48742 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LHX1P48742 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LHX1P48742 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LHX1P48742 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LHX1P48742 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LHX1P48742 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LHX1P48742 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LHX1P48742 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LHX1P48742 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LHX1P48742 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LHX1P48742 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LHX1P48742 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LHX1P48742 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LHX1P48742 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LHX1P48742 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LHX1P48742 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LHX1P48742 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LHX1P48742 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LHX1P48742 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LHX1P48742 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LHX1P48742 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LHX1P48742 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LHX1P48742 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LHX1P48742 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LHX1P48742 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LHX1P48742 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LHX1P48742 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LHX1P48742 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LHX1P48742 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LHX1P48742 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LHX1P48742 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LHX1P48742 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LHX1P48742 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LHX1P48742 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LHX1P48742 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LHX1P48742 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LHX1P48742 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LHX1P48742 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LHX1P48742 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LHX1P48742 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LHX1P48742 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LHX1P48742 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LHX1P48742 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LHX1P48742 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LHX1P48742 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LHX1P48742 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LHX1P48742 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LHX1P48742 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LHX1P48742 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LHX1P48742 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LHX1P48742 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LHX1P48742 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LHX1P48742 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LHX1P48742 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LHX1P48742 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LHX1P48742 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LHX1P48742 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LHX1P48742 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LHX1P48742 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LHX1P48742 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LHX1P48742 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LHX1P48742 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LHX1P48742 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LHX1P48742 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms