Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIA4P48058 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIA4P48058 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIA4P48058 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIA4P48058 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIA4P48058 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIA4P48058 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIA4P48058 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIA4P48058 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIA4P48058 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIA4P48058 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIA4P48058 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIA4P48058 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIA4P48058 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIA4P48058 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIA4P48058 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIA4P48058 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIA4P48058 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIA4P48058 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIA4P48058 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIA4P48058 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIA4P48058 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIA4P48058 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIA4P48058 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIA4P48058 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIA4P48058 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIA4P48058 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIA4P48058 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIA4P48058 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIA4P48058 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIA4P48058 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIA4P48058 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIA4P48058 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIA4P48058 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIA4P48058 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIA4P48058 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIA4P48058 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIA4P48058 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIA4P48058 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIA4P48058 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIA4P48058 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIA4P48058 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIA4P48058 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIA4P48058 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIA4P48058 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIA4P48058 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIA4P48058 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIA4P48058 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIA4P48058 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIA4P48058 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIA4P48058 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIA4P48058 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIA4P48058 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIA4P48058 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIA4P48058 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIA4P48058 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIA4P48058 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIA4P48058 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIA4P48058 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIA4P48058 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIA4P48058 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIA4P48058 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIA4P48058 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIA4P48058 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIA4P48058 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIA4P48058 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIA4P48058 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIA4P48058 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIA4P48058 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIA4P48058 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIA4P48058 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GRIA4P48058 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GRIA4P48058 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRIA4P48058 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRIA4P48058 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRIA4P48058 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRIA4P48058 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRIA4P48058 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRIA4P48058 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRIA4P48058 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRIA4P48058 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRIA4P48058 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRIA4P48058 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRIA4P48058 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRIA4P48058 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIA4P48058 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIA4P48058 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIA4P48058 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIA4P48058 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIA4P48058 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIA4P48058 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIA4P48058 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIA4P48058 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIA4P48058 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIA4P48058 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIA4P48058 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIA4P48058 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIA4P48058 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIA4P48058 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIA4P48058 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms