Protein–RNA interactions for Protein: P47756

CAPZB, F-actin-capping protein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZBP47756 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPZBP47756 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPZBP47756 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPZBP47756 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPZBP47756 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPZBP47756 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPZBP47756 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPZBP47756 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPZBP47756 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPZBP47756 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPZBP47756 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPZBP47756 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPZBP47756 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPZBP47756 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPZBP47756 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPZBP47756 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPZBP47756 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPZBP47756 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPZBP47756 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPZBP47756 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPZBP47756 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPZBP47756 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPZBP47756 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPZBP47756 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPZBP47756 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPZBP47756 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPZBP47756 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPZBP47756 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPZBP47756 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPZBP47756 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPZBP47756 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPZBP47756 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPZBP47756 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPZBP47756 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPZBP47756 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPZBP47756 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPZBP47756 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPZBP47756 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPZBP47756 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPZBP47756 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPZBP47756 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPZBP47756 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPZBP47756 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPZBP47756 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPZBP47756 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPZBP47756 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPZBP47756 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPZBP47756 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPZBP47756 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPZBP47756 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPZBP47756 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPZBP47756 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPZBP47756 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPZBP47756 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPZBP47756 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPZBP47756 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPZBP47756 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPZBP47756 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPZBP47756 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPZBP47756 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPZBP47756 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPZBP47756 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPZBP47756 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPZBP47756 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPZBP47756 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPZBP47756 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPZBP47756 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPZBP47756 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPZBP47756 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPZBP47756 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPZBP47756 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPZBP47756 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPZBP47756 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPZBP47756 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPZBP47756 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPZBP47756 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPZBP47756 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAPZBP47756 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAPZBP47756 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAPZBP47756 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAPZBP47756 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAPZBP47756 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAPZBP47756 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAPZBP47756 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAPZBP47756 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAPZBP47756 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CAPZBP47756 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CAPZBP47756 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CAPZBP47756 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CAPZBP47756 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CAPZBP47756 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CAPZBP47756 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CAPZBP47756 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CAPZBP47756 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CAPZBP47756 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
CAPZBP47756 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAPZBP47756 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAPZBP47756 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAPZBP47756 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAPZBP47756 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms