Protein–RNA interactions for Protein: P46779

RPL28, 60S ribosomal protein L28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL28P46779 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RPL28P46779 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RPL28P46779 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RPL28P46779 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RPL28P46779 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RPL28P46779 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RPL28P46779 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RPL28P46779 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RPL28P46779 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RPL28P46779 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RPL28P46779 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RPL28P46779 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RPL28P46779 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
RPL28P46779 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RPL28P46779 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RPL28P46779 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RPL28P46779 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
RPL28P46779 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
RPL28P46779 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
RPL28P46779 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RPL28P46779 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RPL28P46779 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RPL28P46779 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RPL28P46779 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RPL28P46779 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RPL28P46779 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RPL28P46779 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RPL28P46779 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RPL28P46779 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RPL28P46779 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RPL28P46779 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RPL28P46779 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RPL28P46779 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RPL28P46779 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
RPL28P46779 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RPL28P46779 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RPL28P46779 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RPL28P46779 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RPL28P46779 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RPL28P46779 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RPL28P46779 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RPL28P46779 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RPL28P46779 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RPL28P46779 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RPL28P46779 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RPL28P46779 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RPL28P46779 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RPL28P46779 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RPL28P46779 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RPL28P46779 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RPL28P46779 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RPL28P46779 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RPL28P46779 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RPL28P46779 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RPL28P46779 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RPL28P46779 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RPL28P46779 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RPL28P46779 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RPL28P46779 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RPL28P46779 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RPL28P46779 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RPL28P46779 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RPL28P46779 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
RPL28P46779 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RPL28P46779 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RPL28P46779 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RPL28P46779 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
RPL28P46779 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RPL28P46779 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RPL28P46779 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RPL28P46779 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RPL28P46779 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RPL28P46779 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RPL28P46779 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RPL28P46779 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RPL28P46779 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RPL28P46779 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RPL28P46779 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RPL28P46779 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RPL28P46779 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RPL28P46779 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RPL28P46779 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RPL28P46779 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RPL28P46779 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RPL28P46779 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RPL28P46779 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RPL28P46779 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
RPL28P46779 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RPL28P46779 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RPL28P46779 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RPL28P46779 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RPL28P46779 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RPL28P46779 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
RPL28P46779 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RPL28P46779 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
RPL28P46779 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RPL28P46779 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RPL28P46779 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RPL28P46779 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RPL28P46779 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms