Protein–RNA interactions for Protein: P46459

NSF, Vesicle-fusing ATPase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSFP46459 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NSFP46459 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NSFP46459 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NSFP46459 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NSFP46459 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NSFP46459 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NSFP46459 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NSFP46459 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NSFP46459 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NSFP46459 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NSFP46459 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NSFP46459 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NSFP46459 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NSFP46459 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NSFP46459 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NSFP46459 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NSFP46459 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NSFP46459 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NSFP46459 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NSFP46459 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NSFP46459 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NSFP46459 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NSFP46459 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NSFP46459 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NSFP46459 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NSFP46459 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NSFP46459 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NSFP46459 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NSFP46459 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NSFP46459 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NSFP46459 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NSFP46459 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NSFP46459 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NSFP46459 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NSFP46459 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NSFP46459 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NSFP46459 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NSFP46459 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NSFP46459 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NSFP46459 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NSFP46459 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
NSFP46459 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NSFP46459 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NSFP46459 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NSFP46459 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NSFP46459 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NSFP46459 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NSFP46459 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NSFP46459 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NSFP46459 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NSFP46459 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NSFP46459 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NSFP46459 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NSFP46459 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NSFP46459 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NSFP46459 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NSFP46459 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NSFP46459 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NSFP46459 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NSFP46459 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NSFP46459 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NSFP46459 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NSFP46459 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NSFP46459 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NSFP46459 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NSFP46459 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NSFP46459 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NSFP46459 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NSFP46459 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NSFP46459 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NSFP46459 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NSFP46459 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NSFP46459 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NSFP46459 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NSFP46459 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NSFP46459 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NSFP46459 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NSFP46459 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NSFP46459 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NSFP46459 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NSFP46459 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NSFP46459 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NSFP46459 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NSFP46459 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NSFP46459 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NSFP46459 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NSFP46459 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NSFP46459 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NSFP46459 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NSFP46459 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NSFP46459 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NSFP46459 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NSFP46459 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NSFP46459 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NSFP46459 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NSFP46459 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NSFP46459 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NSFP46459 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NSFP46459 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NSFP46459 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms