Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACADSBP45954 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACADSBP45954 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACADSBP45954 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACADSBP45954 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ACADSBP45954 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACADSBP45954 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACADSBP45954 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACADSBP45954 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACADSBP45954 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACADSBP45954 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACADSBP45954 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACADSBP45954 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACADSBP45954 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACADSBP45954 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACADSBP45954 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACADSBP45954 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACADSBP45954 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACADSBP45954 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACADSBP45954 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACADSBP45954 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACADSBP45954 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACADSBP45954 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACADSBP45954 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACADSBP45954 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACADSBP45954 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACADSBP45954 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACADSBP45954 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACADSBP45954 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACADSBP45954 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACADSBP45954 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACADSBP45954 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ACADSBP45954 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACADSBP45954 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACADSBP45954 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACADSBP45954 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACADSBP45954 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ACADSBP45954 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACADSBP45954 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACADSBP45954 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACADSBP45954 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACADSBP45954 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACADSBP45954 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACADSBP45954 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACADSBP45954 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ACADSBP45954 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACADSBP45954 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACADSBP45954 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACADSBP45954 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACADSBP45954 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACADSBP45954 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACADSBP45954 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACADSBP45954 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACADSBP45954 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACADSBP45954 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACADSBP45954 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACADSBP45954 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACADSBP45954 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACADSBP45954 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACADSBP45954 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACADSBP45954 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ACADSBP45954 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACADSBP45954 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACADSBP45954 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACADSBP45954 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ACADSBP45954 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACADSBP45954 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACADSBP45954 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACADSBP45954 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACADSBP45954 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACADSBP45954 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACADSBP45954 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACADSBP45954 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ACADSBP45954 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACADSBP45954 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACADSBP45954 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACADSBP45954 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACADSBP45954 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACADSBP45954 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACADSBP45954 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACADSBP45954 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACADSBP45954 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACADSBP45954 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACADSBP45954 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACADSBP45954 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACADSBP45954 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACADSBP45954 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACADSBP45954 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACADSBP45954 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACADSBP45954 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACADSBP45954 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACADSBP45954 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ACADSBP45954 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ACADSBP45954 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ACADSBP45954 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ACADSBP45954 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACADSBP45954 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ACADSBP45954 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ACADSBP45954 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ACADSBP45954 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 177.4 ms