Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACTR1BP42025 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACTR1BP42025 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACTR1BP42025 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACTR1BP42025 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACTR1BP42025 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACTR1BP42025 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACTR1BP42025 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACTR1BP42025 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACTR1BP42025 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACTR1BP42025 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACTR1BP42025 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACTR1BP42025 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACTR1BP42025 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACTR1BP42025 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACTR1BP42025 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACTR1BP42025 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACTR1BP42025 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACTR1BP42025 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACTR1BP42025 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACTR1BP42025 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACTR1BP42025 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACTR1BP42025 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACTR1BP42025 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACTR1BP42025 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ACTR1BP42025 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACTR1BP42025 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACTR1BP42025 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ACTR1BP42025 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ACTR1BP42025 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACTR1BP42025 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACTR1BP42025 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACTR1BP42025 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACTR1BP42025 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACTR1BP42025 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACTR1BP42025 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACTR1BP42025 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACTR1BP42025 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACTR1BP42025 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTR1BP42025 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTR1BP42025 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTR1BP42025 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTR1BP42025 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTR1BP42025 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTR1BP42025 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTR1BP42025 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTR1BP42025 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTR1BP42025 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTR1BP42025 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTR1BP42025 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTR1BP42025 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTR1BP42025 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTR1BP42025 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTR1BP42025 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTR1BP42025 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTR1BP42025 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTR1BP42025 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTR1BP42025 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTR1BP42025 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTR1BP42025 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTR1BP42025 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTR1BP42025 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTR1BP42025 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTR1BP42025 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTR1BP42025 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTR1BP42025 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTR1BP42025 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTR1BP42025 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTR1BP42025 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTR1BP42025 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTR1BP42025 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTR1BP42025 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTR1BP42025 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTR1BP42025 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTR1BP42025 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTR1BP42025 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTR1BP42025 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTR1BP42025 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTR1BP42025 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTR1BP42025 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTR1BP42025 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTR1BP42025 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTR1BP42025 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTR1BP42025 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTR1BP42025 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTR1BP42025 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTR1BP42025 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTR1BP42025 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTR1BP42025 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTR1BP42025 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACTR1BP42025 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACTR1BP42025 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACTR1BP42025 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACTR1BP42025 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACTR1BP42025 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACTR1BP42025 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACTR1BP42025 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ACTR1BP42025 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACTR1BP42025 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACTR1BP42025 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms