Protein–RNA interactions for Protein: P40005

GIM4, Prefoldin subunit 2, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GIM4P40005 ROY1YMR258C 1662 nt2.15□□□□□ -2.06
GIM4P40005 IMG2YCR071C 441 nt2.15□□□□□ -2.07
GIM4P40005 SNX4YJL036W 1272 nt2.15□□□□□ -2.07
GIM4P40005 VPS51YKR020W 495 nt2.15□□□□□ -2.07
GIM4P40005 BOS1YLR078C 735 nt2.15□□□□□ -2.07
GIM4P40005 YAR075WYAR075W 474 nt2.15□□□□□ -2.07
GIM4P40005 YOL134CYOL134C 390 nt2.15□□□□□ -2.07
GIM4P40005 SSD1YDR293C 3753 nt2.15□□□□□ -2.07
GIM4P40005 SPB1YCL054W 2526 nt2.15□□□□□ -2.07
GIM4P40005 YJL181WYJL181W 1836 nt2.14□□□□□ -2.07
GIM4P40005 DNL4YOR005C 2835 nt2.14□□□□□ -2.07
GIM4P40005 HUL5YGL141W 2733 nt2.14□□□□□ -2.07
GIM4P40005 YDR179W-AYDR179W-A 1392 nt2.14□□□□□ -2.07
GIM4P40005 MSH4YFL003C 2637 nt2.14□□□□□ -2.07
GIM4P40005 HMO1YDR174W 741 nt2.14□□□□□ -2.07
GIM4P40005 ERG28YER044C 447 nt2.14□□□□□ -2.07
GIM4P40005 RPS24AYER074W 408 nt2.14□□□□□ -2.07
GIM4P40005 RTT105YER104W 627 nt2.14□□□□□ -2.07
GIM4P40005 PEA2YER149C 1263 nt2.14□□□□□ -2.07
GIM4P40005 PEX4YGR133W 552 nt2.14□□□□□ -2.07
GIM4P40005 YHR137C-AYHR137C-A 651 nt2.14□□□□□ -2.07
GIM4P40005 ATP7YKL016C 525 nt2.14□□□□□ -2.07
GIM4P40005 EBP2YKL172W 1284 nt2.14□□□□□ -2.07
GIM4P40005 PEX17YNL214W 600 nt2.14□□□□□ -2.07
GIM4P40005 DGK1YOR311C 873 nt2.14□□□□□ -2.07
GIM4P40005 INP53YOR109W 3324 nt2.14□□□□□ -2.07
GIM4P40005 SEC16YPL085W 6588 nt2.14□□□□□ -2.07
GIM4P40005 MAK5YBR142W 2322 nt2.14□□□□□ -2.07
GIM4P40005 CLN3YAL040C 1743 nt2.14□□□□□ -2.07
GIM4P40005 YNL018CYNL018C 1839 nt2.13□□□□□ -2.07
GIM4P40005 YGL159WYGL159W 1113 nt2.13□□□□□ -2.07
GIM4P40005 YBL055CYBL055C 1257 nt2.13□□□□□ -2.07
GIM4P40005 YOR097CYOR097C 528 nt2.13□□□□□ -2.07
GIM4P40005 POL30YBR088C 777 nt2.13□□□□□ -2.07
GIM4P40005 RGL1YPL066W 1440 nt2.13□□□□□ -2.07
GIM4P40005 UTP22YGR090W 3714 nt2.13□□□□□ -2.07
GIM4P40005 URK1YNR012W 1506 nt2.12□□□□□ -2.07
GIM4P40005 TFC3YAL001C 3483 nt2.12□□□□□ -2.07
GIM4P40005 TIM11YDR322C-A 291 nt2.12□□□□□ -2.07
GIM4P40005 YDR355CYDR355C 303 nt2.12□□□□□ -2.07
GIM4P40005 GCN4YEL009C 846 nt2.12□□□□□ -2.07
GIM4P40005 YGR050CYGR050C 357 nt2.12□□□□□ -2.07
GIM4P40005 LSM8YJR022W 330 nt2.12□□□□□ -2.07
GIM4P40005 CDC123YLR215C 1083 nt2.12□□□□□ -2.07
GIM4P40005 SGT1YOR057W 1188 nt2.12□□□□□ -2.07
GIM4P40005 TPS2YDR074W 2691 nt2.12□□□□□ -2.07
GIM4P40005 CLG1YGL215W 1359 nt2.11□□□□□ -2.07
GIM4P40005 MAK11YKL021C 1407 nt2.11□□□□□ -2.07
GIM4P40005 YBL028CYBL028C 321 nt2.11□□□□□ -2.07
GIM4P40005 YNL144W-AYNL144W-A 84 nt2.11□□□□□ -2.07
GIM4P40005 ATG19YOL082W 1248 nt2.11□□□□□ -2.07
GIM4P40005 YOR314WYOR314W 330 nt2.11□□□□□ -2.07
GIM4P40005 SLM4YBR077C 489 nt2.11□□□□□ -2.07
GIM4P40005 PUT3YKL015W 2940 nt2.11□□□□□ -2.07
GIM4P40005 SSE1YPL106C 2082 nt2.11□□□□□ -2.07
GIM4P40005 KAP123YER110C 3342 nt2.1□□□□□ -2.07
GIM4P40005 MSS2YDL107W 1056 nt2.1□□□□□ -2.07
GIM4P40005 SMX2YFL017W-A 234 nt2.1□□□□□ -2.07
GIM4P40005 MRPL6YHR147C 645 nt2.1□□□□□ -2.07
GIM4P40005 RSM26YJR101W 801 nt2.1□□□□□ -2.07
GIM4P40005 MCR1YKL150W 909 nt2.1□□□□□ -2.07
GIM4P40005 TFA2YKR062W 987 nt2.1□□□□□ -2.07
GIM4P40005 CCW14YLR390W-A 717 nt2.1□□□□□ -2.07
GIM4P40005 YOL107WYOL107W 1029 nt2.1□□□□□ -2.07
GIM4P40005 YML096WYML096W 1578 nt2.1□□□□□ -2.07
GIM4P40005 USO1YDL058W 5373 nt2.09□□□□□ -2.07
GIM4P40005 YLR108CYLR108C 1458 nt2.09□□□□□ -2.07
GIM4P40005 SIR4YDR227W 4077 nt2.09□□□□□ -2.07
GIM4P40005 YGR168CYGR168C 1131 nt2.09□□□□□ -2.07
GIM4P40005 NOP19YGR251W 591 nt2.09□□□□□ -2.07
GIM4P40005 RRF1YHR038W 693 nt2.09□□□□□ -2.07
GIM4P40005 YJL052C-AYJL052C-A 120 nt2.09□□□□□ -2.07
GIM4P40005 YAL042C-AYAL042C-A 378 nt2.09□□□□□ -2.07
GIM4P40005 UBC12YLR306W 567 nt2.09□□□□□ -2.07
GIM4P40005 RPS22BYLR367W 393 nt2.09□□□□□ -2.07
GIM4P40005 PNO1YOR145C 825 nt2.09□□□□□ -2.07
GIM4P40005 MSS18YPR134W 807 nt2.09□□□□□ -2.07
GIM4P40005 SHG1YBR258C 429 nt2.09□□□□□ -2.07
GIM4P40005 KOG1YHR186C 4674 nt2.09□□□□□ -2.08
GIM4P40005 MCD1YDL003W 1701 nt2.08□□□□□ -2.08
GIM4P40005 ALK2YBL009W 2031 nt2.08□□□□□ -2.08
GIM4P40005 YRR1YOR162C 2433 nt2.08□□□□□ -2.08
GIM4P40005 RPN4YDL020C 1596 nt2.08□□□□□ -2.08
GIM4P40005 RPL27BYDR471W 411 nt2.08□□□□□ -2.08
GIM4P40005 YHR052W-AYHR052W-A 195 nt2.08□□□□□ -2.08
GIM4P40005 YHR054W-AYHR054W-A 195 nt2.08□□□□□ -2.08
GIM4P40005 EPT1YHR123W 1176 nt2.08□□□□□ -2.08
GIM4P40005 YIL068W-AYIL068W-A 384 nt2.08□□□□□ -2.08
GIM4P40005 ICY1YMR195W 384 nt2.08□□□□□ -2.08
GIM4P40005 FPR1YNL135C 345 nt2.08□□□□□ -2.08
GIM4P40005 HAT1YPL001W 1125 nt2.08□□□□□ -2.08
GIM4P40005 YEL075CYEL075C 369 nt2.07□□□□□ -2.08
GIM4P40005 BRP1YGL007W 378 nt2.07□□□□□ -2.08
GIM4P40005 SCL1YGL011C 759 nt2.07□□□□□ -2.08
GIM4P40005 YGR149WYGR149W 1299 nt2.07□□□□□ -2.08
GIM4P40005 YGR273CYGR273C 525 nt2.07□□□□□ -2.08
GIM4P40005 MED11YMR112C 396 nt2.07□□□□□ -2.08
GIM4P40005 RBL2YOR265W 321 nt2.07□□□□□ -2.08
GIM4P40005 ARO7YPR060C 771 nt2.07□□□□□ -2.08
GIM4P40005 SDC25YLL016W 3147 nt2.07□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 16 ms