Protein–RNA interactions for Protein: P39086

GRIK1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK1P39086 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIK1P39086 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIK1P39086 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIK1P39086 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIK1P39086 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIK1P39086 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIK1P39086 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIK1P39086 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIK1P39086 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIK1P39086 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIK1P39086 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIK1P39086 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIK1P39086 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIK1P39086 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIK1P39086 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIK1P39086 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIK1P39086 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIK1P39086 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIK1P39086 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIK1P39086 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIK1P39086 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIK1P39086 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIK1P39086 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIK1P39086 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIK1P39086 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIK1P39086 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIK1P39086 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIK1P39086 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIK1P39086 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIK1P39086 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIK1P39086 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIK1P39086 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIK1P39086 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIK1P39086 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIK1P39086 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIK1P39086 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIK1P39086 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIK1P39086 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIK1P39086 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIK1P39086 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIK1P39086 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIK1P39086 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIK1P39086 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIK1P39086 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIK1P39086 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIK1P39086 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIK1P39086 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIK1P39086 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIK1P39086 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIK1P39086 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIK1P39086 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIK1P39086 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIK1P39086 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIK1P39086 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIK1P39086 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIK1P39086 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIK1P39086 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIK1P39086 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIK1P39086 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIK1P39086 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIK1P39086 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIK1P39086 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIK1P39086 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIK1P39086 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIK1P39086 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIK1P39086 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIK1P39086 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIK1P39086 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIK1P39086 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIK1P39086 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIK1P39086 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIK1P39086 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIK1P39086 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIK1P39086 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIK1P39086 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIK1P39086 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIK1P39086 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIK1P39086 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIK1P39086 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIK1P39086 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIK1P39086 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIK1P39086 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIK1P39086 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIK1P39086 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIK1P39086 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIK1P39086 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIK1P39086 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIK1P39086 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIK1P39086 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIK1P39086 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIK1P39086 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIK1P39086 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIK1P39086 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GRIK1P39086 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GRIK1P39086 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GRIK1P39086 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIK1P39086 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIK1P39086 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIK1P39086 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIK1P39086 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms