Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR2IP36954 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR2IP36954 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR2IP36954 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR2IP36954 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR2IP36954 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR2IP36954 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR2IP36954 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR2IP36954 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR2IP36954 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR2IP36954 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR2IP36954 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR2IP36954 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR2IP36954 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR2IP36954 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR2IP36954 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR2IP36954 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR2IP36954 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR2IP36954 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR2IP36954 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR2IP36954 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR2IP36954 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR2IP36954 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR2IP36954 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR2IP36954 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR2IP36954 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR2IP36954 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR2IP36954 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR2IP36954 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR2IP36954 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR2IP36954 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR2IP36954 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR2IP36954 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR2IP36954 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR2IP36954 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR2IP36954 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR2IP36954 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR2IP36954 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR2IP36954 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR2IP36954 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR2IP36954 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR2IP36954 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR2IP36954 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR2IP36954 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR2IP36954 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR2IP36954 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLR2IP36954 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLR2IP36954 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLR2IP36954 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLR2IP36954 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLR2IP36954 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLR2IP36954 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLR2IP36954 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
POLR2IP36954 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLR2IP36954 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLR2IP36954 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
POLR2IP36954 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
POLR2IP36954 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
POLR2IP36954 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
POLR2IP36954 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
POLR2IP36954 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR2IP36954 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR2IP36954 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR2IP36954 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR2IP36954 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR2IP36954 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR2IP36954 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR2IP36954 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR2IP36954 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR2IP36954 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLR2IP36954 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLR2IP36954 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLR2IP36954 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLR2IP36954 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLR2IP36954 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLR2IP36954 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLR2IP36954 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLR2IP36954 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLR2IP36954 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLR2IP36954 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLR2IP36954 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLR2IP36954 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
POLR2IP36954 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
POLR2IP36954 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
POLR2IP36954 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
POLR2IP36954 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLR2IP36954 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLR2IP36954 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLR2IP36954 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLR2IP36954 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLR2IP36954 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLR2IP36954 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLR2IP36954 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLR2IP36954 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLR2IP36954 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLR2IP36954 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLR2IP36954 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
POLR2IP36954 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLR2IP36954 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLR2IP36954 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms