Protein–RNA interactions for Protein: P36896

ACVR1B, Activin receptor type-1B, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1BP36896 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACVR1BP36896 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACVR1BP36896 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACVR1BP36896 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACVR1BP36896 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACVR1BP36896 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ACVR1BP36896 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACVR1BP36896 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACVR1BP36896 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACVR1BP36896 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ACVR1BP36896 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACVR1BP36896 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ACVR1BP36896 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ACVR1BP36896 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ACVR1BP36896 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ACVR1BP36896 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACVR1BP36896 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACVR1BP36896 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACVR1BP36896 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACVR1BP36896 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACVR1BP36896 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACVR1BP36896 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ACVR1BP36896 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACVR1BP36896 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACVR1BP36896 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACVR1BP36896 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACVR1BP36896 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACVR1BP36896 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACVR1BP36896 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACVR1BP36896 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACVR1BP36896 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACVR1BP36896 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACVR1BP36896 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACVR1BP36896 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACVR1BP36896 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACVR1BP36896 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACVR1BP36896 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACVR1BP36896 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACVR1BP36896 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACVR1BP36896 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACVR1BP36896 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACVR1BP36896 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACVR1BP36896 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACVR1BP36896 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACVR1BP36896 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ACVR1BP36896 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACVR1BP36896 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACVR1BP36896 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACVR1BP36896 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ACVR1BP36896 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACVR1BP36896 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACVR1BP36896 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACVR1BP36896 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACVR1BP36896 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACVR1BP36896 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACVR1BP36896 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACVR1BP36896 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACVR1BP36896 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACVR1BP36896 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACVR1BP36896 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACVR1BP36896 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACVR1BP36896 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACVR1BP36896 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACVR1BP36896 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACVR1BP36896 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACVR1BP36896 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACVR1BP36896 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACVR1BP36896 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACVR1BP36896 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACVR1BP36896 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACVR1BP36896 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACVR1BP36896 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACVR1BP36896 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACVR1BP36896 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACVR1BP36896 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACVR1BP36896 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACVR1BP36896 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACVR1BP36896 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACVR1BP36896 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACVR1BP36896 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACVR1BP36896 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACVR1BP36896 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACVR1BP36896 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACVR1BP36896 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACVR1BP36896 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACVR1BP36896 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACVR1BP36896 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACVR1BP36896 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACVR1BP36896 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACVR1BP36896 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACVR1BP36896 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACVR1BP36896 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACVR1BP36896 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACVR1BP36896 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACVR1BP36896 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACVR1BP36896 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACVR1BP36896 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACVR1BP36896 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.62
ACVR1BP36896 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACVR1BP36896 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms