Protein–RNA interactions for Protein: P35908

KRT2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT2P35908 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT2P35908 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT2P35908 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT2P35908 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT2P35908 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT2P35908 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT2P35908 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT2P35908 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT2P35908 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT2P35908 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT2P35908 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT2P35908 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT2P35908 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT2P35908 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT2P35908 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT2P35908 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT2P35908 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT2P35908 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT2P35908 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT2P35908 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT2P35908 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT2P35908 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT2P35908 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT2P35908 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT2P35908 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT2P35908 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT2P35908 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT2P35908 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT2P35908 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT2P35908 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT2P35908 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT2P35908 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT2P35908 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT2P35908 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT2P35908 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT2P35908 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT2P35908 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT2P35908 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT2P35908 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT2P35908 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT2P35908 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT2P35908 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT2P35908 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT2P35908 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT2P35908 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT2P35908 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT2P35908 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT2P35908 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT2P35908 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT2P35908 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT2P35908 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT2P35908 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT2P35908 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT2P35908 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT2P35908 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT2P35908 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT2P35908 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT2P35908 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT2P35908 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT2P35908 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT2P35908 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT2P35908 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT2P35908 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT2P35908 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT2P35908 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT2P35908 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT2P35908 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT2P35908 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT2P35908 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT2P35908 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT2P35908 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT2P35908 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT2P35908 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT2P35908 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT2P35908 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT2P35908 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT2P35908 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT2P35908 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT2P35908 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT2P35908 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT2P35908 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT2P35908 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KRT2P35908 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KRT2P35908 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT2P35908 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KRT2P35908 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KRT2P35908 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT2P35908 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24■■□□□ 1.43
KRT2P35908 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KRT2P35908 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT2P35908 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT2P35908 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KRT2P35908 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT2P35908 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT2P35908 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT2P35908 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT2P35908 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT2P35908 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT2P35908 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT2P35908 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms