Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SFTPDP35247 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SFTPDP35247 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SFTPDP35247 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SFTPDP35247 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SFTPDP35247 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SFTPDP35247 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SFTPDP35247 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SFTPDP35247 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SFTPDP35247 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SFTPDP35247 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SFTPDP35247 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SFTPDP35247 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SFTPDP35247 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SFTPDP35247 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SFTPDP35247 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SFTPDP35247 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SFTPDP35247 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SFTPDP35247 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SFTPDP35247 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SFTPDP35247 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SFTPDP35247 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SFTPDP35247 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SFTPDP35247 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SFTPDP35247 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SFTPDP35247 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SFTPDP35247 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SFTPDP35247 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SFTPDP35247 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SFTPDP35247 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SFTPDP35247 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SFTPDP35247 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SFTPDP35247 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SFTPDP35247 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SFTPDP35247 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SFTPDP35247 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SFTPDP35247 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SFTPDP35247 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SFTPDP35247 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SFTPDP35247 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SFTPDP35247 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SFTPDP35247 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SFTPDP35247 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SFTPDP35247 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SFTPDP35247 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SFTPDP35247 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SFTPDP35247 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SFTPDP35247 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SFTPDP35247 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SFTPDP35247 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SFTPDP35247 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SFTPDP35247 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SFTPDP35247 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SFTPDP35247 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SFTPDP35247 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SFTPDP35247 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SFTPDP35247 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SFTPDP35247 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SFTPDP35247 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SFTPDP35247 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SFTPDP35247 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SFTPDP35247 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SFTPDP35247 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SFTPDP35247 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SFTPDP35247 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SFTPDP35247 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SFTPDP35247 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SFTPDP35247 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SFTPDP35247 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SFTPDP35247 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SFTPDP35247 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SFTPDP35247 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SFTPDP35247 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SFTPDP35247 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SFTPDP35247 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SFTPDP35247 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SFTPDP35247 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SFTPDP35247 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SFTPDP35247 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SFTPDP35247 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SFTPDP35247 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SFTPDP35247 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SFTPDP35247 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SFTPDP35247 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SFTPDP35247 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SFTPDP35247 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SFTPDP35247 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SFTPDP35247 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SFTPDP35247 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SFTPDP35247 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SFTPDP35247 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SFTPDP35247 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SFTPDP35247 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SFTPDP35247 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SFTPDP35247 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SFTPDP35247 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SFTPDP35247 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SFTPDP35247 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SFTPDP35247 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SFTPDP35247 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms