Protein–RNA interactions for Protein: P35236

PTPN7, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN7P35236 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPN7P35236 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPN7P35236 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPN7P35236 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPN7P35236 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPN7P35236 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPN7P35236 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPN7P35236 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPN7P35236 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPN7P35236 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPN7P35236 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPN7P35236 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPN7P35236 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPN7P35236 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPN7P35236 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPN7P35236 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPN7P35236 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPN7P35236 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPN7P35236 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPN7P35236 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPN7P35236 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPN7P35236 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPN7P35236 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPN7P35236 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPN7P35236 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPN7P35236 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPN7P35236 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPN7P35236 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPN7P35236 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPN7P35236 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPN7P35236 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPN7P35236 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPN7P35236 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPN7P35236 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPN7P35236 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPN7P35236 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPN7P35236 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPN7P35236 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPN7P35236 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPN7P35236 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPN7P35236 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPN7P35236 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPN7P35236 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPN7P35236 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPN7P35236 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPN7P35236 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPN7P35236 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPN7P35236 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPN7P35236 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPN7P35236 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPN7P35236 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPN7P35236 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPN7P35236 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPN7P35236 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPN7P35236 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPN7P35236 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPN7P35236 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPN7P35236 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPN7P35236 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPN7P35236 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPN7P35236 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPN7P35236 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPN7P35236 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPN7P35236 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPN7P35236 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPN7P35236 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPN7P35236 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPN7P35236 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPN7P35236 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPN7P35236 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPN7P35236 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPN7P35236 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPN7P35236 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPN7P35236 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPN7P35236 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPN7P35236 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPN7P35236 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPN7P35236 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPN7P35236 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPN7P35236 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPN7P35236 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPN7P35236 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTPN7P35236 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTPN7P35236 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTPN7P35236 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
PTPN7P35236 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPN7P35236 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPN7P35236 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPN7P35236 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPN7P35236 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPN7P35236 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPN7P35236 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPN7P35236 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPN7P35236 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPN7P35236 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPN7P35236 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPN7P35236 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPN7P35236 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPN7P35236 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPN7P35236 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms