Protein–RNA interactions for Protein: P35221

CTNNA1, Catenin alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA1P35221 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTNNA1P35221 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTNNA1P35221 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTNNA1P35221 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTNNA1P35221 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTNNA1P35221 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTNNA1P35221 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTNNA1P35221 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTNNA1P35221 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTNNA1P35221 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTNNA1P35221 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTNNA1P35221 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTNNA1P35221 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTNNA1P35221 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CTNNA1P35221 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CTNNA1P35221 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CTNNA1P35221 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CTNNA1P35221 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CTNNA1P35221 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CTNNA1P35221 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTNNA1P35221 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTNNA1P35221 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTNNA1P35221 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTNNA1P35221 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTNNA1P35221 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTNNA1P35221 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTNNA1P35221 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTNNA1P35221 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTNNA1P35221 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTNNA1P35221 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTNNA1P35221 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTNNA1P35221 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTNNA1P35221 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTNNA1P35221 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTNNA1P35221 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CTNNA1P35221 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTNNA1P35221 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTNNA1P35221 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTNNA1P35221 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTNNA1P35221 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTNNA1P35221 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTNNA1P35221 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTNNA1P35221 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTNNA1P35221 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CTNNA1P35221 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTNNA1P35221 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTNNA1P35221 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTNNA1P35221 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTNNA1P35221 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTNNA1P35221 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTNNA1P35221 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTNNA1P35221 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTNNA1P35221 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTNNA1P35221 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTNNA1P35221 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTNNA1P35221 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTNNA1P35221 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTNNA1P35221 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTNNA1P35221 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTNNA1P35221 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTNNA1P35221 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTNNA1P35221 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTNNA1P35221 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTNNA1P35221 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTNNA1P35221 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTNNA1P35221 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTNNA1P35221 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTNNA1P35221 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CTNNA1P35221 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTNNA1P35221 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTNNA1P35221 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTNNA1P35221 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTNNA1P35221 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTNNA1P35221 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTNNA1P35221 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTNNA1P35221 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTNNA1P35221 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTNNA1P35221 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTNNA1P35221 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTNNA1P35221 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTNNA1P35221 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTNNA1P35221 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTNNA1P35221 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTNNA1P35221 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTNNA1P35221 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTNNA1P35221 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CTNNA1P35221 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTNNA1P35221 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTNNA1P35221 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTNNA1P35221 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTNNA1P35221 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTNNA1P35221 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTNNA1P35221 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTNNA1P35221 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CTNNA1P35221 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTNNA1P35221 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTNNA1P35221 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTNNA1P35221 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTNNA1P35221 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTNNA1P35221 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms