Protein–RNA interactions for Protein: P32297

CHRNA3, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA3P32297 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNA3P32297 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNA3P32297 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNA3P32297 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNA3P32297 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNA3P32297 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNA3P32297 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNA3P32297 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNA3P32297 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNA3P32297 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNA3P32297 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNA3P32297 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNA3P32297 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNA3P32297 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNA3P32297 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNA3P32297 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNA3P32297 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNA3P32297 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNA3P32297 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNA3P32297 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNA3P32297 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNA3P32297 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNA3P32297 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNA3P32297 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNA3P32297 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNA3P32297 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNA3P32297 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNA3P32297 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNA3P32297 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNA3P32297 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNA3P32297 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNA3P32297 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNA3P32297 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNA3P32297 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNA3P32297 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNA3P32297 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNA3P32297 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNA3P32297 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNA3P32297 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNA3P32297 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNA3P32297 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNA3P32297 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNA3P32297 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNA3P32297 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNA3P32297 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNA3P32297 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNA3P32297 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNA3P32297 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNA3P32297 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRNA3P32297 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRNA3P32297 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRNA3P32297 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRNA3P32297 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRNA3P32297 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRNA3P32297 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRNA3P32297 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRNA3P32297 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRNA3P32297 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRNA3P32297 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRNA3P32297 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRNA3P32297 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRNA3P32297 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRNA3P32297 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRNA3P32297 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRNA3P32297 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CHRNA3P32297 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CHRNA3P32297 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNA3P32297 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNA3P32297 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNA3P32297 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNA3P32297 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNA3P32297 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNA3P32297 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNA3P32297 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNA3P32297 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNA3P32297 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNA3P32297 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNA3P32297 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNA3P32297 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNA3P32297 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNA3P32297 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNA3P32297 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNA3P32297 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNA3P32297 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNA3P32297 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CHRNA3P32297 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHRNA3P32297 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHRNA3P32297 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CHRNA3P32297 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CHRNA3P32297 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CHRNA3P32297 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CHRNA3P32297 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHRNA3P32297 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CHRNA3P32297 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CHRNA3P32297 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CHRNA3P32297 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CHRNA3P32297 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CHRNA3P32297 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CHRNA3P32297 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22■■□□□ 1.11
CHRNA3P32297 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms