Protein–RNA interactions for Protein: P32247

BRS3, Bombesin receptor subtype-3, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRS3P32247 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BRS3P32247 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BRS3P32247 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BRS3P32247 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BRS3P32247 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BRS3P32247 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BRS3P32247 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BRS3P32247 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BRS3P32247 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BRS3P32247 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BRS3P32247 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BRS3P32247 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BRS3P32247 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BRS3P32247 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
BRS3P32247 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
BRS3P32247 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
BRS3P32247 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BRS3P32247 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BRS3P32247 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BRS3P32247 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BRS3P32247 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BRS3P32247 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BRS3P32247 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BRS3P32247 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BRS3P32247 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BRS3P32247 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BRS3P32247 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BRS3P32247 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BRS3P32247 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BRS3P32247 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BRS3P32247 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BRS3P32247 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BRS3P32247 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BRS3P32247 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BRS3P32247 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BRS3P32247 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BRS3P32247 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BRS3P32247 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BRS3P32247 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BRS3P32247 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BRS3P32247 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BRS3P32247 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BRS3P32247 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BRS3P32247 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BRS3P32247 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BRS3P32247 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BRS3P32247 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BRS3P32247 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BRS3P32247 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BRS3P32247 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BRS3P32247 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BRS3P32247 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BRS3P32247 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BRS3P32247 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BRS3P32247 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BRS3P32247 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BRS3P32247 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BRS3P32247 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BRS3P32247 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BRS3P32247 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BRS3P32247 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BRS3P32247 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
BRS3P32247 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BRS3P32247 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BRS3P32247 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BRS3P32247 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BRS3P32247 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BRS3P32247 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
BRS3P32247 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BRS3P32247 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BRS3P32247 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BRS3P32247 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BRS3P32247 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BRS3P32247 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BRS3P32247 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
BRS3P32247 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BRS3P32247 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BRS3P32247 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BRS3P32247 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BRS3P32247 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BRS3P32247 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BRS3P32247 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BRS3P32247 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
BRS3P32247 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BRS3P32247 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BRS3P32247 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BRS3P32247 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BRS3P32247 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BRS3P32247 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BRS3P32247 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BRS3P32247 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BRS3P32247 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BRS3P32247 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BRS3P32247 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BRS3P32247 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BRS3P32247 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BRS3P32247 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BRS3P32247 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BRS3P32247 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BRS3P32247 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms