Protein–RNA interactions for Protein: P32239

CCKBR, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKBRP32239 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCKBRP32239 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCKBRP32239 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCKBRP32239 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCKBRP32239 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCKBRP32239 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCKBRP32239 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCKBRP32239 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCKBRP32239 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCKBRP32239 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCKBRP32239 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCKBRP32239 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCKBRP32239 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCKBRP32239 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCKBRP32239 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCKBRP32239 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCKBRP32239 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCKBRP32239 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCKBRP32239 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCKBRP32239 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCKBRP32239 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCKBRP32239 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCKBRP32239 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCKBRP32239 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCKBRP32239 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCKBRP32239 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCKBRP32239 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCKBRP32239 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CCKBRP32239 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCKBRP32239 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCKBRP32239 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCKBRP32239 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCKBRP32239 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCKBRP32239 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCKBRP32239 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCKBRP32239 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCKBRP32239 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCKBRP32239 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCKBRP32239 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCKBRP32239 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCKBRP32239 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCKBRP32239 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCKBRP32239 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCKBRP32239 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCKBRP32239 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCKBRP32239 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCKBRP32239 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCKBRP32239 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCKBRP32239 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCKBRP32239 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCKBRP32239 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCKBRP32239 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCKBRP32239 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCKBRP32239 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCKBRP32239 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCKBRP32239 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCKBRP32239 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCKBRP32239 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCKBRP32239 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCKBRP32239 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCKBRP32239 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCKBRP32239 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCKBRP32239 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCKBRP32239 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCKBRP32239 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCKBRP32239 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCKBRP32239 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCKBRP32239 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCKBRP32239 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCKBRP32239 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCKBRP32239 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCKBRP32239 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCKBRP32239 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCKBRP32239 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCKBRP32239 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCKBRP32239 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCKBRP32239 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCKBRP32239 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCKBRP32239 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCKBRP32239 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCKBRP32239 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCKBRP32239 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCKBRP32239 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCKBRP32239 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCKBRP32239 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCKBRP32239 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCKBRP32239 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CCKBRP32239 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCKBRP32239 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCKBRP32239 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCKBRP32239 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCKBRP32239 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCKBRP32239 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCKBRP32239 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCKBRP32239 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCKBRP32239 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCKBRP32239 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCKBRP32239 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCKBRP32239 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCKBRP32239 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.8 ms