Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms