Protein–RNA interactions for Protein: P29400

COL4A5, Collagen alpha-5(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A5P29400 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL4A5P29400 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL4A5P29400 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL4A5P29400 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL4A5P29400 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
COL4A5P29400 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL4A5P29400 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
COL4A5P29400 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL4A5P29400 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL4A5P29400 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL4A5P29400 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL4A5P29400 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL4A5P29400 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL4A5P29400 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL4A5P29400 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL4A5P29400 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL4A5P29400 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL4A5P29400 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL4A5P29400 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL4A5P29400 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL4A5P29400 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COL4A5P29400 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
COL4A5P29400 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COL4A5P29400 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COL4A5P29400 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
COL4A5P29400 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COL4A5P29400 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COL4A5P29400 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COL4A5P29400 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COL4A5P29400 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COL4A5P29400 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COL4A5P29400 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
COL4A5P29400 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
COL4A5P29400 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COL4A5P29400 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COL4A5P29400 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
COL4A5P29400 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
COL4A5P29400 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
COL4A5P29400 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.67
COL4A5P29400 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
COL4A5P29400 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
COL4A5P29400 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
COL4A5P29400 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
COL4A5P29400 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
COL4A5P29400 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
COL4A5P29400 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
COL4A5P29400 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
COL4A5P29400 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
COL4A5P29400 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
COL4A5P29400 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
COL4A5P29400 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
COL4A5P29400 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
COL4A5P29400 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
COL4A5P29400 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
COL4A5P29400 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
COL4A5P29400 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
COL4A5P29400 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
COL4A5P29400 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
COL4A5P29400 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
COL4A5P29400 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
COL4A5P29400 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COL4A5P29400 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COL4A5P29400 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COL4A5P29400 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COL4A5P29400 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
COL4A5P29400 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
COL4A5P29400 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
COL4A5P29400 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
COL4A5P29400 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
COL4A5P29400 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
COL4A5P29400 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
COL4A5P29400 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
COL4A5P29400 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
COL4A5P29400 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
COL4A5P29400 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL4A5P29400 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL4A5P29400 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL4A5P29400 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL4A5P29400 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
COL4A5P29400 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL4A5P29400 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
COL4A5P29400 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL4A5P29400 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL4A5P29400 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL4A5P29400 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL4A5P29400 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL4A5P29400 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL4A5P29400 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL4A5P29400 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL4A5P29400 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL4A5P29400 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
COL4A5P29400 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL4A5P29400 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
COL4A5P29400 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL4A5P29400 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL4A5P29400 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL4A5P29400 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL4A5P29400 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL4A5P29400 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL4A5P29400 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms