Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GTF2E2P29084 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GTF2E2P29084 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GTF2E2P29084 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GTF2E2P29084 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GTF2E2P29084 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GTF2E2P29084 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GTF2E2P29084 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GTF2E2P29084 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GTF2E2P29084 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GTF2E2P29084 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GTF2E2P29084 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GTF2E2P29084 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GTF2E2P29084 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
GTF2E2P29084 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
GTF2E2P29084 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GTF2E2P29084 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GTF2E2P29084 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GTF2E2P29084 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GTF2E2P29084 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GTF2E2P29084 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GTF2E2P29084 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GTF2E2P29084 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GTF2E2P29084 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GTF2E2P29084 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GTF2E2P29084 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF2E2P29084 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF2E2P29084 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF2E2P29084 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF2E2P29084 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF2E2P29084 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF2E2P29084 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF2E2P29084 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF2E2P29084 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF2E2P29084 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF2E2P29084 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF2E2P29084 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF2E2P29084 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF2E2P29084 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF2E2P29084 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF2E2P29084 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF2E2P29084 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF2E2P29084 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF2E2P29084 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF2E2P29084 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF2E2P29084 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF2E2P29084 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF2E2P29084 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF2E2P29084 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF2E2P29084 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF2E2P29084 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF2E2P29084 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF2E2P29084 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF2E2P29084 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF2E2P29084 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF2E2P29084 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF2E2P29084 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF2E2P29084 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF2E2P29084 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF2E2P29084 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF2E2P29084 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF2E2P29084 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF2E2P29084 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF2E2P29084 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF2E2P29084 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF2E2P29084 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF2E2P29084 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GTF2E2P29084 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF2E2P29084 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF2E2P29084 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF2E2P29084 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF2E2P29084 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF2E2P29084 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF2E2P29084 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF2E2P29084 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF2E2P29084 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF2E2P29084 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF2E2P29084 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF2E2P29084 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF2E2P29084 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF2E2P29084 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF2E2P29084 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF2E2P29084 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF2E2P29084 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF2E2P29084 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GTF2E2P29084 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GTF2E2P29084 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GTF2E2P29084 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GTF2E2P29084 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
GTF2E2P29084 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GTF2E2P29084 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GTF2E2P29084 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF2E2P29084 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF2E2P29084 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF2E2P29084 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF2E2P29084 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF2E2P29084 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF2E2P29084 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF2E2P29084 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF2E2P29084 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms