Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXD10P28358 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXD10P28358 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXD10P28358 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXD10P28358 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXD10P28358 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXD10P28358 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXD10P28358 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXD10P28358 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXD10P28358 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXD10P28358 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXD10P28358 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXD10P28358 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXD10P28358 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXD10P28358 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXD10P28358 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXD10P28358 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXD10P28358 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXD10P28358 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXD10P28358 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXD10P28358 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXD10P28358 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXD10P28358 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXD10P28358 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXD10P28358 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXD10P28358 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXD10P28358 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXD10P28358 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXD10P28358 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXD10P28358 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXD10P28358 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXD10P28358 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXD10P28358 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXD10P28358 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXD10P28358 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXD10P28358 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXD10P28358 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXD10P28358 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXD10P28358 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXD10P28358 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXD10P28358 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXD10P28358 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXD10P28358 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXD10P28358 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXD10P28358 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXD10P28358 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXD10P28358 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXD10P28358 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXD10P28358 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXD10P28358 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXD10P28358 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXD10P28358 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXD10P28358 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXD10P28358 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXD10P28358 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXD10P28358 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXD10P28358 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXD10P28358 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXD10P28358 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXD10P28358 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXD10P28358 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXD10P28358 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXD10P28358 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXD10P28358 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXD10P28358 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXD10P28358 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXD10P28358 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXD10P28358 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXD10P28358 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXD10P28358 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXD10P28358 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXD10P28358 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXD10P28358 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXD10P28358 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXD10P28358 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXD10P28358 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXD10P28358 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXD10P28358 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXD10P28358 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXD10P28358 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXD10P28358 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXD10P28358 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXD10P28358 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXD10P28358 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXD10P28358 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXD10P28358 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXD10P28358 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXD10P28358 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXD10P28358 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXD10P28358 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXD10P28358 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXD10P28358 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXD10P28358 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXD10P28358 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXD10P28358 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXD10P28358 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXD10P28358 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXD10P28358 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXD10P28358 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXD10P28358 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms