Protein–RNA interactions for Protein: P23471

PTPRZ1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1P23471 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRZ1P23471 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRZ1P23471 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRZ1P23471 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRZ1P23471 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRZ1P23471 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRZ1P23471 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRZ1P23471 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRZ1P23471 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRZ1P23471 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRZ1P23471 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRZ1P23471 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRZ1P23471 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRZ1P23471 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRZ1P23471 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRZ1P23471 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRZ1P23471 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRZ1P23471 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRZ1P23471 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRZ1P23471 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRZ1P23471 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRZ1P23471 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRZ1P23471 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRZ1P23471 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRZ1P23471 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRZ1P23471 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRZ1P23471 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRZ1P23471 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRZ1P23471 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRZ1P23471 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRZ1P23471 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRZ1P23471 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRZ1P23471 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRZ1P23471 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRZ1P23471 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRZ1P23471 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPRZ1P23471 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPRZ1P23471 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPRZ1P23471 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPRZ1P23471 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPRZ1P23471 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPRZ1P23471 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPRZ1P23471 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPRZ1P23471 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRZ1P23471 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRZ1P23471 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRZ1P23471 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRZ1P23471 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRZ1P23471 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRZ1P23471 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRZ1P23471 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRZ1P23471 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRZ1P23471 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRZ1P23471 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRZ1P23471 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRZ1P23471 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRZ1P23471 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRZ1P23471 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRZ1P23471 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRZ1P23471 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRZ1P23471 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRZ1P23471 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRZ1P23471 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRZ1P23471 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRZ1P23471 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRZ1P23471 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRZ1P23471 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRZ1P23471 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRZ1P23471 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRZ1P23471 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRZ1P23471 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRZ1P23471 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRZ1P23471 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRZ1P23471 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRZ1P23471 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRZ1P23471 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRZ1P23471 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRZ1P23471 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRZ1P23471 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRZ1P23471 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRZ1P23471 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRZ1P23471 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRZ1P23471 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRZ1P23471 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRZ1P23471 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRZ1P23471 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRZ1P23471 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRZ1P23471 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRZ1P23471 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRZ1P23471 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRZ1P23471 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRZ1P23471 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRZ1P23471 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRZ1P23471 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRZ1P23471 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRZ1P23471 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRZ1P23471 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRZ1P23471 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRZ1P23471 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRZ1P23471 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms